应用高通量测序技术检测与奶牛乳产量和乳质量调控相关的miRNA

发布时间：2017-08-22 15:03

  本文关键词：应用高通量测序技术检测与奶牛乳产量和乳质量调控相关的miRNA

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【摘要】：本实验将中国荷斯坦牛泌乳期高乳品质奶牛(H)和泌乳期低乳品质奶牛(L)乳腺组织作为实验对象,利用高通量测序技术进行了miRNA测序,与miRNA数据库比对,获得已知miRNA,整合miREvo和mir Deep2这两个miRNA预测软件,进行新miRNA分析,通过差异表达分析筛选组间差异miRNAs,获得56个差异表达miRNA(P0.05,FDRq0.05)并对差异表达miRNA进行靶基因预测;利用DAVID对靶基因进行GO(Gene Ontology)和信号通路富集分析。经过对靶基因筛选,发现了4个已报道与乳蛋白、乳脂紧密相关的功能基因:CSN3、SCD、LALBA和DGAT2。靶基因聚集的生物学功能多数参与了蛋白质和脂肪代谢,乳腺发育和分化,以及免疫功能。靶基因主要富集在MAPK信号通路、甘油磷酸脂质代谢、缺氧诱导因子1和磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B信号转导通路。结果显示,靶基因主要富集在糖类代谢、脂肪代谢、蛋白质代谢、细胞凋亡以及免疫相关通路。
【作者单位】： 东北农业大学乳品科学教育部重点实验室;
【关键词】： 中国荷斯坦牛 乳成分 small RNA-seq
【基金】：国家重点基础研究发展计划(973计划,No.2011CB100804)~~
【分类号】：S823
【正文快照】： 国家重点基础研究发展计划(973计划,No.2011CB100804)*联系人Tel:0451-55191416;E-mail:wangcm-1@163.com,qzli@neau.edu.cnReceived:January 22,2016;Accepted:March 23,2016Supported by National Basic Research and Development Program of China(973 Program,No.2011CB10

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