猪伪狂犬病毒Fa株侵染对PK-15细胞microRNAs表达谱的影响

发布时间：2017-08-26 10:08

  本文关键词：猪伪狂犬病毒Fa株侵染对PK-15细胞microRNAs表达谱的影响

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【摘要】：【目的】分析猪伪狂犬病毒Fa株(PRV-Fa)侵染对猪肾传代细胞PK-15 microRNAs(miRNAs)表达谱的影响。【方法】利用Illumina高通量测序技术,鉴定感染和非感染PRV-Fa的PK-15细胞的miRNAs;筛选并利用实时荧光定量RT-PCR(RT-q PCR)验证差异表达miRNAs;对差异miRNAs进行靶基因预测和Gene ontology(GO)分析。【结果】在感染和未感染PK-15细胞中分别检测到384个和405个miRNAs,其中感染PRV-Fa后差异表达的miRNAs共127个(60个上调,67个下调)。荧光定量结果显示差异miRNAs的表达趋势与高通量测序结果一致。GO分析显示,miRNAs广泛参与信号传导、细胞代谢、免疫反应、基因表达等生物学进程,其中miR-10b、miR-16、miR-18a、miR-19b、miR-20a、miR-145-5p、miR-146a、miR-181a、miR-499-5p等miRNAs与免疫相关。在靶基因调控网络图中,ssc-miR-30a-5p与ssc-miR-30d处于关键位置。研究鉴定出5个新的病毒编码miRNAs,其中PRV-miR-LLT2与PRV-miR-LLT4靶向PRV早期蛋白基因EPO。【结论】伪狂犬病毒Fa株感染对PK-15细胞编码miRNAs有显著影响。
【作者单位】： 四川农业大学动物生物技术中心;动物疫病与人类健康四川省重点实验室;
【关键词】： 猪伪狂犬病毒 microRNAs 高通量测序 PK-细胞
【正文快照】： 伪狂犬病是由α-疱疹病毒甲亚科的伪狂犬病毒(Pseudorabies virus,PRV)引起,可导致母猪流产或产弱胎、死胎、木乃伊胎,导致公猪睾丸炎等,是危害我国养猪业的重大疾病之一。自1813年报道发生以来,目前伪狂犬病已呈世界性分布。我国虽长期采取广泛的免疫、净化措施,但该病仍呈局

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