鸡脚重性状的全基因组关联分析

发布时间：2017-09-13 06:14

  本文关键词：鸡脚重性状的全基因组关联分析

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【摘要】：鸡(Gallus gallus)脚重性状为鸡产业中的重要经济性状。为了揭示鸡脚重性状的遗传基础,寻找可用于鸡脚改良的分子标记,本研究以核心群京海黄鸡为实验动物,测定其脚重,利用简化基因组测序技术在整个基因组范围内检测与脚重相关的SNPs。共检测到16个与脚重相关的SNPs位点,其中13个集中分布在4号染色体上72.8~77.9 Mb区域;2个SNP位点rs475641139和rs475548810达到5%Bonferroni全基因组显著水平(P5.5E-07),其余位点达到全基因组潜在显著水平(P1.1E-05)。筛选每个SNP周围1 Mb区域内的基因,共找到9个可能的候选基因,并使用基因本体论(Gene Ontology,GO)数据库对9个候选基因的细胞组分、分子功能和参与的生物学进程进行了分析。结果表明二氢蝶啶还原酶(dihydropteridine deductase,QDPR)基因、LIM域结合蛋白2(LIM domain-binding protein 2,LDB2)基因、类184B家族(family with sequence similarity 184 member B,FAM184B)基因、复合信号免疫球蛋白J结合蛋白(recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region,RBPJ)基因、纤维母细胞生长因子结合蛋白2(fibroblast growth factor-binding protein 2,FGFBP2)基因、富亮氨酸重复蛋白5(F-box and leucine-rich repeat protein 5,FBXL5)基因、胆囊收缩素受体A(cholecystokinin receptor type A,CCK1R)基因、肌动蛋白互作蛋白1(WD repeat containing protein 1,WDR1)基因和类桶状蛋白4(tubby like protein 4,TULP4)9个基因和4号染色体72.8~77.9 Mb区域可能为影响鸡脚重性状的重要候选基因和潜在功能区域。本研究为鸡脚重性状的标记辅助选择提供了理论依据。
【作者单位】： 江苏农牧科技职业学院宠物科技学院;宜春学院生命科学与资源环境学院;扬州大学动物科学与技术学院;
【关键词】： 简化基因组测序 脚重 全基因组关联分析 TASSEL模型
【基金】：国家肉鸡产业技术体系(No.nycytx-42-G1-05)
【分类号】：S831.2
【正文快照】： 学院,扬州225009鸡(Gallus gallus)脚即鸡爪,又名鸡掌、凤爪、凤足,鸡爪作为一种食材,深受人们的的喜爱,且富含谷氨酸,胶原蛋白和钙质,不但能软化血管,同时具有美容功效。据相关统计,2010年凤爪在我国的销售额达到30~40亿元,因此,找出能够影响鸡脚重的分子标记,进而对该性状进

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本文编号：841987