可乐猪乳头数性状全基因组关联分析

发布时间：2017-09-26 12:15

  本文关键词：可乐猪乳头数性状全基因组关联分析

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【摘要】：乳头数性状是猪最重要的繁殖性状之一,与养猪业的经济效益密切相关。本试验以Illunima Porcine SNP60K芯片对22头可乐猪进行基因分型,通过Plink 1.07软件,基于混合线性模型对左乳头数、右乳头数和总乳头数性状进行全基因组关联分析。经过严格的质量控制和多重检验之后,共鉴定出全基因组水平潜在关联的SNPs位点4个(P2.06E-5);染色体水平显著关联位点3个,潜在关联位点18个;在关联SNP位点可能连锁的上、下游1cM区间内检索到304个基因,其中Wnt及Fgf信号通路中的候选基因BTRC、FGF5、FGF8和BMP3、RASGEF1B、HMGB3可能影响猪的乳头数性状或繁殖性状。通过全基因组关联分析策略发掘出的关联SNP位点及潜在候选基因,将为可乐猪的选育保种奠定基础。
【作者单位】： 贵州大学生命科学学院;贵州大学农业生物工程研究院;贵州大学动物科学学院;铜仁学院;
【关键词】： SNP芯片 全基因组关联分析 乳头数
【基金】：国家高技术研究发展计划(863计划)课题(2013AA102503) 贵州大学创新基金(2015009);贵州大学“本科教学工程”项目(BKJX2012007) 贵州省农业攻关项目(黔科合NY[2013]3073号) 贵州省科技创新人才团队建设专项(黔科合人才团队2009-4006)
【分类号】：S828
【正文快照】： 繁殖性状不仅影响母猪的繁殖力,而且直接影响养猪业的经济效益。乳头数是一个具有中等遗传力的复杂性状,有相对稳定的遗传特性,是衡量母猪哺育能力的非常重要的指标之一,其遗传力评估值大多为0.22h20.41,母猪的乳头数与产仔数、产活仔数、断奶体重等有着较强的相关性[1]。全

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本文编号：923438