安徽东流水牛线粒体D-Loop区遗传多样性与系统进化分析

发布时间：2017-09-27 21:40

  本文关键词：安徽东流水牛线粒体D-Loop区遗传多样性与系统进化分析

  更多相关文章： 水牛 线粒体DNA 遗传多样性 单倍型

【摘要】：【目的】分析安徽东流水牛群体的分子遗传特性,为今后开展我国地方水牛品种研究提供科学依据。【方法】采用测序技术测定安徽东至县31头东流水牛线粒体DNA(mtDNA)D-Loop序列,结合GenBank数据库中已报道的22个群体的471条中国水牛D-Loop序列进行联合分析,利用DnaSP 5.1软件统计核苷酸多样性和单倍型多样性,利用MEGA 5.10软件构建N-J系统发生树,利用Network 4.60软件构建单倍型的media-joining网络。【结果】在22个中国水牛群体中发现163个变异位点,180个单倍型,其核苷酸多样性为0.018 23±0.002 21,单倍型多样性为0.877 40±0.013 80,其中在东流水牛D-Loop序列中发现70个变异位点,构成35种单倍型,其核苷酸多样性为0.013 31±0.002 08,单倍型多样性为0.944 00±0.023 00,群体变异性水平与中国其他水牛群体接近。N-J系统发生树和media-joining进化网络显示,中国水牛分为沼泽型和江河型,前者又分为A和B支系,B支系包括b1和b22个亚支系,东流水牛分布于A和B支系中。【结论】东流水牛群体遗传多样性丰富,且线粒体具有2个母系来源。
【作者单位】： 安徽省农业科学院畜牧兽医研究所;
【关键词】： 水牛 线粒体DNA 遗传多样性 单倍型
【基金】：国家肉牛牦牛产业技术体系项目-合肥综合试验站(CARS-38) 安徽省农业科学院院长青年创新基金项目(14B0428)
【分类号】：S823.83
【正文快照】： 水牛是我国南方的传统家畜,主要分布于北纬36°以南,东经97°以东的广大地区[1],是我国热带、亚热带水稻区的主要役畜,在农业生产和畜牧业生产中具有重要的经济价值。据2013年联合国粮农组织FAO统计(http://faostat.fao.org),我国水牛存栏数2 300多万头,居世界第3位。在系统分

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 杨东英;;德州驴线粒体DNA D-loop多态性分析[J];广东农业科学;2008年09期

2 雷初朝,陈宏,王德解,杨公社,孙维斌;关中驴线粒体DNA D-loop多态性分析[J];中国畜牧杂志;2004年04期

3 ;[J];;年期

，

本文编号：932057