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鹅细小病毒HN株的分离鉴定及全基因组序列分析

发布时间:2017-10-01 21:25

  本文关键词:鹅细小病毒HN株的分离鉴定及全基因组序列分析


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【摘要】:为研究鹅细小病毒(GPV)基因遗传变异特征,采集海南某养鹅场疑似鹅细小病毒感染的病料,将其处理后接种番鸭胚成功分离到一株病毒,经PCR鉴定为鹅细小病毒,命名为HN株,并获得了其全基因组序列,将该序列与GenBank数据库中登录的16条鹅和番鸭细小病毒基因序列进行了比对分析。结果显示,该株病毒基因组全长为5 106bp,由ITR、NS、VP构成,其中ITR为444bp,NS1为1 844bp,VP1为2 199bp;HN株与SHFX1201株的NS1基因和VP1同源性最高,分别达到99.8%和99.7%,与番鸭细小病毒株FM的NS1基因同源性最低,为82.7%;与90-0215株VP1同源性最低,为80.1%。HN株的遗传进化树可以看出,GPV可以分成明显的2个基因亚群,HN株与鹅细小病毒匈牙利株(B)、欧洲疫苗株(VG32/1)和台湾株(82-0321V、82-0321、06-0329)均处在第I亚群,且与安徽分离株Y株以及SHFX1201株同源性最接近,番鸭源匈牙利株FM单独处于第Ⅱ亚群。本研究丰富了GPV的数据资料,为研究GPV分类地位以及遗传进化关系提供了依据,同时也为研究GPV流行趋势和疫苗的开发奠定了基础。
【作者单位】: 海南省农业科学院畜牧兽医研究所;西南民族大学生命科学与技术学院;
【关键词】鹅细小病毒 分离鉴定 全基因组 IRT NS VP
【基金】:海南省属科研院所技术开发研究专项(KYYS-2015-13) 海南省自然科学基金项目(20153085) 现代农业产业技术体系专项资金项目(CARS-43)
【分类号】:S852.65
【正文快照】: 鹅细小病毒病又称小鹅瘟(Derzsy′s disease orGosling plaque),是由鹅细小病毒(Goose parvovirus,GPV)所引起的雏鹅急性或亚急性的败血性传染病。临床上以精神委靡,离群独偶,鼻孔流出浆液性鼻液,患鹅频频摇头,拉灰黄色或黄绿色稀粪,神经紊乱,小肠中后段黏膜坏死脱落与纤维素

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本文编号:955767

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