全身型幼年特发性关节炎的肠道微生物结构特征研究

发布时间：2021-11-20 07:33

　　目的:幼年特发性关节炎（Juvenile idiopathic arthritis,JIA）是儿童时期最常见的慢性风湿性疾病。全身型JIA（Systemic-onset JIA,SoJIA）是其最严重的亚型之一。尽管SoJIA的发病机制尚不清楚,但最近一些研究表明肠道菌群失调与JIA之间存在相关性,了解SoJIA肠道微生物组特点有助于了解SoJIA的发病机制,为治疗甚至预防疾病的提供新的思路。本研究旨在探讨全身型幼年特发性关节炎（SoJIA）的肠道微生物特征,并评估其肠道微生物与临床指标之间的相关性。方法:本研究为一项单中心病例对照研究。连续入组2017年7月至2018年12月就诊于北京协和医院的SoJIA儿童,同期招募健康儿童作为对照组。SoJIA儿童在来医院就诊时采集新鲜粪便样本并收集临床资料,根据Wallace标准将SoJIA患儿分为活动组或非活动组。提取粪便基因组DNA,扩增其16S rDNA的V4区,并应用Illumina HiSeq平台测序,分析肠道菌群结构。结果:本研究共纳入SoJIA儿童32例,年龄6-16岁,其中活动SoJIA 17例（男性9例,女性8例）,非活动So... 

【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章页数】：76 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

患者流程图

３．２．１粪便ＤＮＡ的提取结果??（１）粪便ＤＮＡ样本定量及质控提示提取的基因组ＤＮＡ浓度及纯度良好，部??分样本基因组ＤＮＡ的琼脂凝胶电泳结果见图３－２。??ｍｍ??图３－２．部分粪便基因组ＤＮＡ的凝胶电泳??１９??

?博士学位论文??（２）?ＰＣＲ扩增后的部分产物琼脂凝胶电泳结果见图３－３，其中标本１０号和１３??号未检测到目的条带，余标本ＰＣＲ产物电泳条带清晰。对１０号和１３号标本进行??第２次扩增，２次扩增后目的产物条带清晰，可进行建库测序，见图３－４。??图３－３．部分样本ＰＣＲ产物的凝胶电泳??＿??图３－４．二次扩增后标本１０号和１３号ＰＣＲ产物的凝胶电泳??３．２．２?ＯＴＵ的生成及物种注释??基于Ｉｌｌｕｍｉｎａ?ＨｉＳｅｑ平台测序所得的１６Ｓ?ｒＤＮＡ序列经过Ｆｌａｓｈ软件进行拼接、??过滤和质控后，６４例样本共获得５２７０３２８条有效序列，平均每个样本有效序列数为??８２３４９条，最多９６７４１条／样本，最少５２６５１条／样本。以９７％的一致性将序列聚类成??２０??

【参考文献】：
期刊论文
[1]普拉梭菌及其上清液对葡聚糖酸钠诱导的结肠炎小鼠Treg/Th17平衡的影响[J]. 张敏,于成功.  胃肠病学和肝病学杂志. 2017(12)
[2]不加权算术平均组对方法的改进及应用[J]. 李玉鑑,徐立业.  北京工业大学学报. 2007(12)



本文编号：3506861