儿童噬血细胞综合征的PRF1和UNC13D基因内含子变异的研究

发布时间：2017-09-03 13:35

  本文关键词：儿童噬血细胞综合征的PRF1和UNC13D基因内含子变异的研究

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【摘要】：目的：了解噬血细胞综合征患儿的PRF1和UNC13D基因内含子是否存在变异,初步探讨内含子变异型与儿童噬血细胞综合征是否存在相关性。方法：(1)收集2009年1月2013年5月来自广西、广州、武汉、苏州确诊为噬血细胞综合征的48例患儿,经基因检测PRF1和UNC13D基因外显子变异阴性(HLH组)。对照组为50名门诊健康体检的正常儿童。(2)应用PCR分段扩增HLH组和对照组儿童的PRF1和UNC13D基因的内含子,直接测序后分别与基因库的人类PRF1和UNC13D基因序列进行比对。结果：(1)在48例HLH患儿PRFl基因内含子发现4个单核苷酸多态性位点(SNIP)：g.5179de1G (rs55974750)25例(52.08%)、g.5452CT(rs3758562)46例(95.83%)、g.5936TC (rs6480460)47例(97.91%)、g.7745TC (rs80019657)10例(20.83%),其在HLH组和对照组中的等位基因频率差别均无统计学意义(P0.05)。此外,2个SNP位点g.7494CT(rs10999426)和g.7473GA(rs 10999427)仅在2例正常儿童中发现(4%),它们在HLH组和对照组的等位基因频率亦无统计学差别((P0.05)。连锁不平衡分析提示rs10999426和rs10999427紧密连锁(D,=1,r2=1),但其构建的单体型在HLH组和对照组中的分布差异无统计学意义(P0.05)。(2)在UNC13D基因内含子共发现20个SNP位点：g.5527GA(rs3744011)29例(60.4%)、g.5556CT(rs3744010)8例(16.7%)、g.6301CT(rs9903200)10例(20.8%)、g.6433GA(rs3744009)10例(20.8%).g.585CG. (rs3744008)7例(14.6%).g.6628GA(rs142996967)2例(4.2%).g.6942GA (rs11870883)8例(16.7%).g.6983CT(rs3744006)35例(72.9%)、g.8657TG (rs8067076)29例(60.4%).g.8825CA(rs6501838)2例(4.2%)、g.9072GA (rs7208603)2例(4.2%).g.9358CT(rs7226310)1例(2.1％).g.9381CT (rs201406035)2例(4.2%).g.13899AG(rs3744026)26例(54.2%)、 g.14141 TC(rs3744024)27例(56.3%).g.14803GA(rs17581728)7例 (14.6%). g.15529CT (rs7212635)28 例 (58.3%). g.16806CT (rs113796451)5例(10.4%).g.19188CT(rs2290768)28例0(58.3%)、 g.19393CG(rs2290769)9例(18.8%).其中rs8067076在HLH组和对照组的等位基因频率差异有统计学意义(P=0.0460.05)。连锁不平衡分析提示rs6501838和rs7208603紧密连锁(D=1,r2=1),其等位基因频率和构建的单体型在HLH组和对照组的分布差异无统计学意义(P0.05)。余17个SNP位点在HLH组和对照组的等位基因分布差异均无统计学意义(P值均0.05)。此外,4例患儿在内含子1各发现一种碱基变异型：IVS1+238CT、IVS1+394CT.IVS1+466GA,IVSl+498CA,6例患儿在内含子29发现同一个碱基变异型IVS29+62AT,均为杂合子,在对照组中未发现,其在HLH组和对照组的等位基因频率分布差异有统计学意义(P=0.0340.05)。结论：(1)PRF1基因内含子的4个SNP和UNC13D基因内含子的1勺个SNP在HLH组和对照组的等位基因分布无显著性差异,与儿童HLH发病相关性不大；(2)PRF1基因内含子的2个SNP(rs10999426和rs10999427)存在连锁不平衡关系,其构建的A-T单体型虽仅在正常组中发现,但发生率低,可能并不是HLH的保护性因素。而UNC13D基因内含子的1个SNP(rs8067076)可能是HLH的一种保护因素。(3)在UNC13D基因深度内含子发现1个已报道的致病性内含子突变型IVS1+394CT和4个新的内含子变异型IVS1+238CT、IVS1+466GA、 IVS1+498CA、IVS29+62AT,发生率低,后者是否与HLH有关尚有待进一步研究探讨。
【关键词】：噬血细胞综合征 PRF1 UNC13D 内含子 儿童
【学位授予单位】：广西医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R725.5
【目录】：

• 个人简历3-5
• 摘要5-8
• ABSTRACT8-11
• 前言11-13
• 第一部分 儿噬血细胞综合征的PRF1基因内含子变异的研究13-25
• 材料与方法13-18
• 1.实验材料13-14
• 2.研究对象14-15
• 3.实验方法15-18
• 结果18-23
• 1.病例资料18
• 2. PGR产物测序结果及统计分析18-23
• 讨论23-25
• 第二部分儿童噬血细胞综合征的UNC13D基因内含子变异的研究25-44
• 材料与方法25-27
• 1.实验材料和研究对象25
• 2.实验方法25-27
• 结果27-38
• 讨论38-44
• 结论44-45
• 参考文献45-50
• 附录50-51
• 综述51-61
• 参考文献56-61
• 致谢61-62
• 硕士研究生在读期间发表的论文62

【参考文献】

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1 陆文娴;罗建明;;儿童噬血细胞性淋巴组织细胞增生症的预后因素分析[J];中国当代儿科杂志;2012年08期

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本文编号：785331