miR-363靶基因预测及生物信息学分析

发布时间：2018-12-25 14:13

【摘要】：目的 :初步明确hsa-miR-363潜在的生物学功能。方法:首先通过miRbase、UCSC等在线数据库对hsa-miR-363的碱基序列、基因位点及序列保守性进行分析;其次选择miranda、miRDB、Pic Tar及Target Scan四个在线数据库预测hsa-miR-363的靶基因并取交集,筛选后的靶基因用于后续分析;最后通过基因GO功能注释、富集分析和KEGG信号转导通路富集分析,初步阐明hsa-miR-363靶基因参与调控的细胞功能与信号通路。结果:根据生物信息学分析的结果显示,hsa-miR-363的功能较广泛,其多个潜在靶基因均参与子宫内膜异位症发生、发展过程中的多个生物学进程。结论:hsa-miR-363很可能与子宫内膜异位症的发病机制密切相关,并有可能为临床的靶向治疗提供潜在的新靶点。
[Abstract]:Objective: to identify the potential biological function of hsa-miR-363. Methods: the base sequence, gene locus and sequence conserved of hsa-miR-363 were analyzed by miRbase,UCSC and other online databases. Secondly, four online databases of miranda,miRDB,Pic Tar and Target Scan were selected to predict the target genes of hsa-miR-363 and intersected. The selected target genes were used for subsequent analysis. Finally, the cellular function and signal pathway regulated by hsa-miR-363 target gene were elucidated by gene GO function annotation, enrichment analysis and KEGG signal transduction pathway enrichment analysis. Results: according to the results of bioinformatics analysis, hsa-miR-363 has a wide range of functions and many potential target genes are involved in the occurrence and development of endometriosis. Conclusion: hsa-miR-363 may be closely related to the pathogenesis of endometriosis and may provide a potential new target for clinical targeted therapy.
【作者单位】： 南京医科大学第一临床医学院;南京医科大学附属南京市妇幼保健院妇科;南京中医药大学第一临床医学院;
【分类号】：R711.7

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本文编号：2391238