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高级别浆液性卵巢癌侵袭转移相关lncRNA的筛选及鉴定

发布时间:2020-04-01 17:04
【摘要】:背景:卵巢癌是女性生殖系统中致死率最高的恶性肿瘤,由于其早期病变的隐匿性,大多数人被确诊时已是晚期,癌灶的侵袭与转移是导致卵巢癌患者预后不良的主要因素之一,目前尚无有效的早期筛查和诊断的手段。高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)是卵巢癌最常见的组织类型。越来越多的证据表明长链非编码RNA(lncRNA)在卵巢癌中表达并发挥着重要的调节作用,因此,探索HGSOC转移的机制并寻找新的分子标志物和治疗靶点用于阻断癌细胞盆腹腔转移并提高该特定人群中的五年生存率是至关重要的。方法:通过lncRNA基因芯片研究3例HGSOC患者的卵巢癌原发灶和配对大网膜转移灶中的差异lncRNA表达谱,并采用共表达网络图基于芯片报告基础上分析HGSOC中于与CTD-2020K17.1表达存在相关性的基因。采用Real-timePCR技术检测38例配对卵巢癌原发灶和大网膜转移灶的HGSOC组织中CTD-2020K17.1的表达,并通过这些数据分析CTD-2020K17.1表达与HGSOC患者临床病理特征的相关性。结果:通过基因芯片分析我们发现了一个全新的lncRNACTD-2020K17.1。CTD-2020K17.1在卵巢癌大网膜转移灶中表达显著高于原发灶(P0.05)。通过共表达网络图分析,我们发现CTD-2020K17.1与CARD11在HGSOC中的表达具有相关性。此外,CTD-2020K17.1在卵巢癌原发灶和大网膜转移灶的相对表达与患者的CA125水平相关(P0.05)。结论:CTD-2020K17.1在卵巢癌大网膜转移灶中显著上调并且与CARD11的表达相关,或参与了CARD11的调控。此外,CTD-2020K17.1在HGSOC中与CA-125的表达水平显著相关。CTD-2020K17.1或促进高级别浆液性卵巢癌的侵袭与转移。
【图文】:

差异表达,芯片,倍数,聚类分析


3 结 果3.1lncRNA在 HGSOC中的差异表达谱首先,我们采用 ArraystarHumanLncRNAs芯片检测了来自 3例来自 HGSOC患者的配对卵巢癌原发灶组织和大网膜转移灶组织的 lncRNA差异表达谱分布(图3.1A)。通过芯片筛选共获得 18617个差异性表达的 lncRNA,其中 OMTs相对于POCTs表达上调的 lncRNA37个(fold-change>2;p<0.05),,表达下调的 lncRNA22个(fold-change,>2;p<0.05)(图 3.1B)。经筛选,我们发现了一个从未被报导过的lncRNACTD-2020K17.1,其表达上调最为显著,且被收录于 Gencodedatabase数据库中。

网络图,共表达,网络图


6表达网络分析表达网络图(co-expressionnetworkofcoding-non-codinggenes计算在 HGSOC中差异表达的 lncRNA和 mRNA之间的 Pearson相图所示(图 3.2),共表达网络图列举了 15个与 lncRNACTD-2020潜在的靶基因,通过 pubmed数据库检索发现,其中一个基因 CA袭转移紧密相关,然而 CARD11与目的 lncRNA二者间具体的相互的分子机制有待进一步深入的探究。
【学位授予单位】:中国医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R737.31

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本文编号:2610726

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