基于二代测序及临床病理评分标准评价子宫内膜和卵巢双发癌的研究
发布时间:2020-12-21 17:18
目的探究临床病理学评分标准与二代测序技术相结合用于辅助同时性子宫内膜和卵巢双发癌(synchronous endometrial and ovarian carcinomas,SEOCs)患者的诊断及预后评价,从而指导临床个体化治疗。方法收集2010年1月至2017年5月的68例经术后病理证实的同时性子宫内膜和卵巢双发癌、2011年1月至2011年12月的50例子宫内膜样子宫内膜癌患者的临床病理资料。根据Scully病理诊断标准对同时性双发癌人群进行分组。基于该诊断标准及相关临床研究数据,制定评分标准,对该人群重新分组。采用全基因外显子测序方法对其中一例SEOCs进行测序。通过与相关文献的研究数据进行比对,找出该患者子宫内膜肿瘤中与发病风险显著相关的突变基因,为后续大量标本实验验证做准备。排除所有子宫内膜和卵巢均为浆液性癌的双发癌,对同时性子宫内膜样的子宫内膜和卵巢双发癌、单发卵巢癌及单发子宫内膜癌进行回顾性分析。各组患者间临床特点及病理特征方面的对比研究采用卡方检验进行分析。使用Kaplan-Meier统计学方法计算总生存率(OS)。结果1.根据Scully标准,68例同时性双发癌患...
【文章来源】:天津医科大学天津市 211工程院校
【文章页数】:44 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
评分系统分组结果
图2 Scully诊断标准和评分系统分组后各组间总生存率对比。(1)Scully分组后双原发癌与转移癌间的总生存率比较(P=0.059);(2)评分系统分组后双原发癌与转移癌间的总生存率比较(P=0.010)。2.4 全外显子测序结果为了进一步明确评分为 2 的病例组的分组,对该组患者的两肿物进行全外显子测序,并与外周血中的正常 DNA 相匹配,排除存在于血液中的突变,明确配对肿瘤之间的起源关系,其中位测序深度为 147.2×(范围为 78.95~228.46×)。由于组织样本质量等原因,在本研究中仅 1 例测序成功,测序结果如下:2.4.1 突变特征不同的突变特征揭示了癌症发展背后突变过程的多样性,对于了解癌症病因,预防和治疗具有潜在的意义。本研究中两配对样本的突变特征如图所示,即以 NpCpG 三核苷酸 C 取代 T(C> T)为主(图 3)。这种突变特征可以在约83.3%的癌症类型中观察到,也是子宫体肿瘤与卵巢肿瘤中常见的突变特征之一[21]。
图 3 测序病例体细胞 SNVs 的突变特征2.4.2 克隆相关性我们分析了体细胞突变的等位基因频率,这些频率反映了肿瘤样本的中心克隆数和遗传组成(图 4.1)。EEC 与 EOC 两个样本具有不同的克隆结构。在EOC 样品中检测到两个峰,在 EEC 样品中检测到 1 峰。2 个样本对应频率的突变密度也不一致,在 EEC 样品中,除了主克隆以外,还有亚克隆结构。根据这一观察结果,推测这两个部位的肿瘤很可能是不同起源。比较子宫内膜肿瘤和卵巢肿瘤样本之间的突变相似性,以确定该病例是否具有遗传独立性。我们已鉴定出在卵巢和子宫内膜肿瘤中共有 97 个 SNVs 和 156个 INDELs 突变。共同的体细胞 SNVs / INDELs 突变的鉴定比例分别为 5.2%和7.9%,远低于我们的预期(图 4.2-4.5)。如果两个肿瘤是同义起源,它们将会具有更多共同的 SNVs 和 INDELs。
本文编号:2930189
【文章来源】:天津医科大学天津市 211工程院校
【文章页数】:44 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
评分系统分组结果
图2 Scully诊断标准和评分系统分组后各组间总生存率对比。(1)Scully分组后双原发癌与转移癌间的总生存率比较(P=0.059);(2)评分系统分组后双原发癌与转移癌间的总生存率比较(P=0.010)。2.4 全外显子测序结果为了进一步明确评分为 2 的病例组的分组,对该组患者的两肿物进行全外显子测序,并与外周血中的正常 DNA 相匹配,排除存在于血液中的突变,明确配对肿瘤之间的起源关系,其中位测序深度为 147.2×(范围为 78.95~228.46×)。由于组织样本质量等原因,在本研究中仅 1 例测序成功,测序结果如下:2.4.1 突变特征不同的突变特征揭示了癌症发展背后突变过程的多样性,对于了解癌症病因,预防和治疗具有潜在的意义。本研究中两配对样本的突变特征如图所示,即以 NpCpG 三核苷酸 C 取代 T(C> T)为主(图 3)。这种突变特征可以在约83.3%的癌症类型中观察到,也是子宫体肿瘤与卵巢肿瘤中常见的突变特征之一[21]。
图 3 测序病例体细胞 SNVs 的突变特征2.4.2 克隆相关性我们分析了体细胞突变的等位基因频率,这些频率反映了肿瘤样本的中心克隆数和遗传组成(图 4.1)。EEC 与 EOC 两个样本具有不同的克隆结构。在EOC 样品中检测到两个峰,在 EEC 样品中检测到 1 峰。2 个样本对应频率的突变密度也不一致,在 EEC 样品中,除了主克隆以外,还有亚克隆结构。根据这一观察结果,推测这两个部位的肿瘤很可能是不同起源。比较子宫内膜肿瘤和卵巢肿瘤样本之间的突变相似性,以确定该病例是否具有遗传独立性。我们已鉴定出在卵巢和子宫内膜肿瘤中共有 97 个 SNVs 和 156个 INDELs 突变。共同的体细胞 SNVs / INDELs 突变的鉴定比例分别为 5.2%和7.9%,远低于我们的预期(图 4.2-4.5)。如果两个肿瘤是同义起源,它们将会具有更多共同的 SNVs 和 INDELs。
本文编号:2930189
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