基于生物信息学分析探索中晚期宫颈鳞癌基因组学与化疗敏感性及预后的关系
发布时间:2021-10-21 18:27
目的:宫颈癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,也是导致女性癌症死亡的主要原因之一。通过筛查,侵袭性宫颈癌的发病率和死亡率大大降低,然而每年仍有相当数量的患者被诊断为中晚期宫颈癌(ⅡB-Ⅳ期),病理类型以鳞状细胞癌为主。虽然以顺铂为基础的同步放化疗的应用使宫颈癌的治疗得到了改善,然而即使是身体状况和病变特征非常相似的患者,对同一治疗方案的效果也存在明显的个体差异现象,一部分患者的肿瘤得到控制或治愈,而另一部分患者的肿瘤治疗无效甚至进展。近年来从分子生物学角度解释这种个体差异现象成为研究热点。因此,我们试图通过分析中晚期宫颈鳞癌患者的基因突变谱与顺铂治疗敏感性、无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)的关系,发现具有临床意义的个体遗传学特征来优化治疗方案的选择。方法:首先我们通过TCGAbiolinks从TCGA数据库中获取所有宫颈癌(Cervical Squamous Cell Carcinoma and Endocervical Adenocarcinoma,CESC)病例的临床信息和测序数据,从中筛选出接受同步放化疗且使用顺铂放疗增敏的ⅡB-Ⅳ期宫颈鳞状细胞癌患者。然后对这些患者的基因突变...
【文章来源】:南方医科大学广东省
【文章页数】:58 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一章 前言
第二章 研究方法
2.1 TCGA数据集获取
2.2 Cox比例风险回归模型分析
2.3 GDSC基因突变与药物敏感性分析
2.4 差异表达基因筛选及通路富集分析
2.5 Kaplan-Meier生存分析
2.6 统计学方法
第三章 研究结果
3.1 TCGA宫颈鳞癌患者的临床病理特征
3.2 TCGA宫颈癌患者和GDSC宫颈癌细胞系的基因突变概况
3.3 RB1突变是OS的独立影响因素
3.4 RB1突变影响宫颈癌细胞对顺铂的敏感性
3.5 RB1突变可能通过下调PI3K/AKT信号通路影响顺铂敏感性
第四章 讨论
第五章 结论
参考文献
攻读学位期间成果
致谢
本文编号:3449503
【文章来源】:南方医科大学广东省
【文章页数】:58 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一章 前言
第二章 研究方法
2.1 TCGA数据集获取
2.2 Cox比例风险回归模型分析
2.3 GDSC基因突变与药物敏感性分析
2.4 差异表达基因筛选及通路富集分析
2.5 Kaplan-Meier生存分析
2.6 统计学方法
第三章 研究结果
3.1 TCGA宫颈鳞癌患者的临床病理特征
3.2 TCGA宫颈癌患者和GDSC宫颈癌细胞系的基因突变概况
3.3 RB1突变是OS的独立影响因素
3.4 RB1突变影响宫颈癌细胞对顺铂的敏感性
3.5 RB1突变可能通过下调PI3K/AKT信号通路影响顺铂敏感性
第四章 讨论
第五章 结论
参考文献
攻读学位期间成果
致谢
本文编号:3449503
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/fuchankeerkelunwen/3449503.html
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