miR-518b靶向EGR1参与早期胚胎停育的机制研究

发布时间：2022-01-25 17:41

　　本研究通过转录组测序（RNA-seq）和Small RNA-seq,并引入mRNA和miRNA整合分析方法,鉴定与早期胚胎停育（Early Embryonic Arrest,EEA）相关的关键基因和miRNA,并通过比较基因组学和结构序列分析方法预测人基因组中的新miRNAs。利用双荧光素酶报告基因系统初步鉴定早期胚胎停育相关靶基因与miRNA的互作关系。我们首先比较了早期胚胎停育患者和正常早期妊娠（Normal pregnency,NP）妇女绒毛组织的转录组测序结果和microRNA谱。我们发现,在早期胚胎停育患者的绒毛组织中,miR-518b异常高表达,进一步预测miR-518b的靶基因并比对转录组测序结果,发现Early growth response protein 1（EGR1）可能为miR-518b的靶基因,双荧光素酶报告试验证实miR-518b直接靶向EGR1 3’UTR端,且EGR1在早期胚胎停育绒毛组织中异常低表达。因此,我们深入研究了miR-518b通过靶向EGR1在胚胎停育发病机制中的调控作用。第一章:通过转录组RNA测序鉴定与胚胎停育相关的候选基因。利用高通量测... 

【文章来源】：广西医科大学广西壮族自治区

【文章页数】：157 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

琼脂糖凝胶电泳的结果

miR-518b靶向EGR1参与早期胚胎停育的机制研究 博士学位论文在EEA组和NP组中发现了190个差异表达基因（P <0.01，FDR q <0.05和| log2FC |> 1）。其中，61 个下调基因，129 个上调基因（P <0.05，FDR q<0.05 和| log2FC |> 1）。差异表达基因的火山图及部分差异表达的基因热图见图 1-2。190 个差异基因的细节、名称，以及 p 和 q 值，显示在附录一中。

图 1-3 关于样品之间基因表达的相关性的热图。Figure 1-3 Heat map of the correlation about gene expression between samples.1.4.2 差异表达基因的 q-PCR 验证为了检验测序的可靠性，我们随机选择了 10 个通过 Transcriptome-S筛选有差异表达的基因，包括 STAT5A，SLC4A1，CP，NNAT，ITGA9，ELK1，TPPP3，PAEP，KLF1 和 EGR1，使用 q-PCR 技术进一步验证其在绒毛组织（EEA，n = 20 和 NP，n = 20）中的表达。q-PCR 的结果与 RNA-S结果一致（图 1-4）。 这些结果进一步证实了 RNA-Seq 的可靠性。

【参考文献】：
期刊论文
[1]妊娠期糖尿病胎盘组织hsa-miR95-5p、hsa-miR-548am-5p和hsa-miR-1246的表达及意义[J]. 李伟,胡宝春,龚照.  实用医学杂志. 2016(04)
[2]has-miR-27a和has-miR-124a基因单核苷酸多态性与妊娠期糖尿病的相关性[J]. 王晓晶,聂敏,李伟,平凡,马良坤,高劲松,刘俊涛.  基础医学与临床. 2014(11)
[3]胚胎着床的分子调控网络[J]. 雷伟,杨增明.  生理科学进展. 2010(06)



本文编号：3608967