基于RNA-seq技术对重度子痫前期孕妇胎盘组织差异性表达circRNA的研究

发布时间：2024-11-06 20:00

　　 研究环状RNA在重度子痫前期患者胎盘组织与正常胎盘组织中表达的差异性。选取重度子痫前期(sPE)患者、正常妊娠孕妇的胎盘组织各3例,应用高通量测序技术检测两组样本中环状RNA的表达情况,使用miRanda软件对筛选出的环状RNA进行miRNA靶基因预测。有3 007个环状RNA在实验组与对照组中均有表达,其中差异表达的环状RNA共有89个,包含44个上调基因和45个下调基因。多数筛选出的差异表达环状RNA具有has-let-7、miR-100、miR-101、miR-103家族成员的结合位点。研究表明胎盘组织中环状RNA的表达失调可能参与了sPE的发生发展过程。

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【部分图文】：

共检测出12000个circRNA,其中有3007个在对照组和实验组中均有表达(图1)。比较这3007个circRNA,发现89个差异性表达的circRNA,其中上调的circRNA有44个,下调的circRNA有45个(图2)。上调和下调的circRNA差异倍数在5倍以上....

图1circRNA的维恩图表1上调/下调倍数前十的差异性表达circRNA基因名实验组readcount对照组readcountlog2FoldChangepvalhsa_circ₀0043831154.530000....

在筛选出的89个circRNA中,发现有75个circRNA具有has-let-7家族成员的结合位点,与miR-100、miR-101、miR-103家族成员有结合位点的circRNA个数分别是49、53和65个。与这4种miRNA均有合位点的circRNA有40个。其中,hsa....

本文编号：4011525