基于癌症基因组图谱筛查卵巢浆液性囊腺癌相关基因

发布时间：2017-08-29 07:18

  本文关键词：基于癌症基因组图谱筛查卵巢浆液性囊腺癌相关基因

  更多相关文章： 卵巢浆液性囊腺癌 基因芯片 差异表达 基因功能 信号通路

【摘要】：目的:利用全基因组表达谱芯片筛查与卵巢浆液性囊腺癌发生相关的基因,对在卵巢浆液性囊腺癌发生过程中可能参与的基因间的信号转导通路进行分析。方法:选取癌症基因组图谱(TCGA)数据库中卵巢浆液性囊腺癌的Affymetrix Gene Chip Human Exon 1.0 ST Array数据共16张,分别为卵巢浆液性囊腺癌组8张和正常组8张,筛选出差异表达基因,并进行基因本体(gene ontology,GO)分析和信号通路分析,构建卵巢浆液性囊腺癌相关基因间的信号转导通路,分析网络中具有重要作用的基因。结果:共筛选出1 144个在卵巢癌中差异表达的基因,其中表达上调的基因有747个,表达下调的基因有397个。GO分析得到上调差异基因的显著性功能分析结果362项,下调差异基因的显著性功能分析结果 160项(P0.05)。其中包括与肿瘤发生相关的基因功能有细胞周期、DNA复制、细胞增殖、细胞凋亡、细胞黏附等。信号通路分析得到45个显著上调信号通路和14个显著下调信号通路(P0.05)。其中参与肿瘤发生相关的信号通路主要有细胞周期、P53信号通路、DNA复制、肿瘤中的信号通路、PI3K-Akt信号通路、ECM-receptor信号通路、细胞黏附因子、细胞凋亡等。挑选显著性基因功能和信号通路分析的交集基因229个,构建显著性GO与信号通路基因间信号转导网络。分析发现CDK1、PLK1、MCM3和PGK1这4个基因在卵巢癌的基因调控网络中具有重要作用。结论:卵巢浆液性囊腺癌中有大量差异表达基因,差异表达的基因在多个与肿瘤发生密切相关的信号通路中发挥重要的调控作用。
【作者单位】： 东北师范大学医院内科;首都医科大学附属北京天坛医院临床医学研究实验室;
【关键词】： 卵巢浆液性囊腺癌 基因芯片 差异表达 基因功能 信号通路
【基金】：国家自然科学基金资助项目(No.81303268) 北京市自然科学基金资助项目(No.7152098)
【分类号】：R737.31
【正文快照】： 卵巢癌的发病率仅次于子宫颈癌和子宫内膜癌,是女性生殖系统致死率最高的恶性肿瘤,占所有因癌症死亡女性患者的3%。卵巢癌的特点是起病隐匿,约85%患者首次诊断多为晚期,易播散转移,术后易复发和易产生化疗耐药等。随着手术和化疗水平的提高,卵巢癌患者的生存率虽然得到了改善,

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前5条

1 韦丽娅;姚婷婷;陈庆瑜;沈青丽;林仲秋;;基因芯片筛选上调miRNA-205表达后HeLa细胞相关基因[J];国际妇产科学杂志;2012年05期

2 冠潇;李力;黎丹戎;阮和云;尹永硕;张玮;;应用功能分类基因芯片筛选卵巢癌淋巴结定向高转移细胞系中差异性表达基因[J];现代妇产科进展;2008年01期

3 戴翔;胡f^江;;妊娠期高血压疾病相关基因的研究进展[J];医学综述;2011年13期

4 王琪;尹茳平;王鹤;唐勇;张玮;李力;;紫杉醇诱导的卵巢癌耐药基因表达谱与信号通路分析[J];肿瘤预防与治疗;2011年06期

5 ;[J];;年期

中国重要会议论文全文数据库 前1条

1 许沈华;牟瀚舟;朱赤红;钱丽娟;羊正炎;应晔;刘祥麟;;卵巢癌基因表达谱研究[A];中国细胞生物学学会2005年学术大会、青年学术研讨会论文摘要集[C];2005年

，

本文编号：752011