ZNF347和ZNF426基因多态性与非综合征性唇腭裂在中国人群中的关联性研究

发布时间：2020-10-30 13:08

　　 研究背景：唇腭裂(Cleft Lip and/or Palate, CL/P)是一种常见但不致命的出生缺陷,属于主要的颅面发育畸形之一,具有复杂病因和遗传异质性的特点。大约70%的唇腭裂患者具有独立的症状,并未涉及到其他明显或可辨别的结构畸形,称为非综合征性唇腭裂(Non-syndromic cleft lip and or palate,NSCL/P)。作为一种复杂的多基因遗传病,非综合征性唇腭裂是遗传因素和环境因素共同作用的结果。锌指蛋白在基因的表达调控、细胞分化、胚胎发育等生命过程中发挥重要作用。目前,一些报道指出锌指蛋白基因与非综合征性唇腭裂有关。前期工作中对唇腭裂家系进行外显子组测序得到候选基因锌指蛋白347(ZNF347)和锌指蛋白426(ZNF426),本文探讨了这两个基因的多态性与非综合征性唇腭裂(NSCL/P)之间的关系,为了解NSCL/P形成的分子机制、寻找有临床意义的遗传易感标记提供了基础理论依据。方法：本文采用的是病例-对照研究,样本包括502例唇腭裂患者和482例健康对照者；涉及三个基因位点,其中rs10417172和rs2195310属于基因ZNF347上的位点,rs2042199则属于ZNF426基因上的位点,两个基因均是本实验室前期通过外显子组测序得到的候选基因。实验采用PCR-RFLP的方法对所有样本进行基因分型,所得结果通过统计学软件SPSS 19.0和在线软件SHEsis进行统计,分析得到的P值经过Bonferroni校正,P值仍然小于0.05的数据被认为是具有统计学意义的；P值大于0.05的数据,再经过多重检验阳性发现错误率(FDR校正法),未超过阈值的可以看做仍然具有统计学意义。结果：在病例组和对照组中,rs10417172位点的突变型杂合子CT型和最小等位基因C表现出明显的统计学意义：CT型(P=0.004, OR=1.657,95%置信区间CI:0.936-1.628), C等位基因(P=0.002, OR=1.648,95% CI:1.202～2.260);rs2195310位点的突变型杂合子GA基因型也表现出明显的统计学意义(p=0.005, OR=1.582,95% CI:1.145-2.186)。性别分层后,rs10417172位点的C等位基因在男性中存在着统计学差异(P=0.008, OR=1.696,95% CI:1.144～2.515)；对于rs2195310位点,携带GA基因型和等位基因A的个体具有更高患唇腭裂的风险：(GA基因型：p=0.014, OR=1.627,95% CI:1.103-2.399),(等位基因A:p=0.030,OR=1.452,95%CI:1.036-2.037).唇腭裂病例分型分层后,在CPO组,rs10417172位点的CT型和等位基因C存在着显著的统计学差异,(CT型：p=281281177144373E-4,OR=1.584,95%CI:1.032-2.433),(等位基因C：p=4.6804035508758566E.4,OR=,2.548,95%CI:1.484-4.376)；rs2195310位点的GA基因型也存在着显著的统计学差异(p=0.027,OR=1.706,95%CI：1.060-2.745)。结论：本文是首例研究锌指蛋白家族成员的ZNF347和ZNF426基因多态性与非综合征性唇腭裂的关联性。结果表明ZNF347基因上的rs10417172位点,CT基因型和C等位基因与非综合征性唇腭裂的发病风险有显著的相关性；ZNF347基因上的另一位点rs2195310位点,GA基因型和A等位基因与非综合征性唇腭裂的发病风险有明显的关联性,本文的结果从分子流行病学角度为非综合征性唇腭裂(NSCL/P)的发病机制提供一定的理论依据,所发现的多态位点有可能作为临床转化研究中的分子检测标记。
【学位单位】：兰州大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2013
【中图分类】：R782.2
【文章目录】：
缩略词表
中文摘要
Abstract
前言
    1 唇腭裂
        1.1 唇腭裂概述
        1.2 唇腭裂分类
        1.3 影响非综合征性唇腭裂的因素
    2 ZNF347和ZNF426基因概述
        2.1 锌指蛋白
        2.2 ZNF347和ZNF426基因
材料和方法
    1 实验材料
        1.1 研究对象
        1.2 主要试剂和仪器
    2 实验方法
        2.1 基因组DNA的提取
        2.2 DNA样本质检
        2.3 SNP选择
        2.4 聚合酶链式反应（PCR扩增）和基因分型
        2.5 测序
        2.6 PCR产物及基因分型结果质量控制
        2.7 数据分析
结果
    1 不同位点基因型和等位基因频率检测结果
        1.1 ZNF347和ZNF426基因位点PCR产物电泳结果
        1.2 ZNF347基因rs104171712位点的基因多态性
        1.3 ZNF347基因rs2195310位点的基因多态性
        1.4 ZNF426基因rs2195310位点的基因多态性
    2 单倍型分析
讨论
    1 ZNF347基因与非综合征性唇腭裂的关系
        1.1 rs10417172位点与非综合征性唇腭裂的关系
        1.2 rs2195310位点与非综合征性唇腭裂的关系
    2 ZNF426基因与非综合征性唇腭裂的关系
    3 19号染色体与唇腭裂的关系
结论
参考文献
在学期间的研究成果
致谢

【共引文献】

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本文编号：2862518