特应性皮炎与银屑病之间差异表达的微小RNA及其生物学功能

发布时间：2024-12-11 21:43

　　 目的探讨特应性皮炎(AD)与银屑病之间差异表达的微小RNA(miRNA)及其生物学功能。方法采用第二代测序技术对8例AD及8例银屑病皮损组织的miRNA表达谱进行高通量测序,筛选差异表达的miRNA。使用实时荧光定量PCR技术,选取上、下调表达差异显著的miRNA进行高通量测序结果的验证。针对差异表达miRNA进行靶基因预测,取交集后进行基因本体功能及京都基因和基因组百科全书通路富集分析。结果 AD与银屑病相比,有204个差异表达的miRNA,包括168个表达上调的miRNA和36个表达下调的miRNA。上调基因hsa-miRNA-133a-3p和下调基因hsa-miRNA-199b-3p的验证结果与检测结果具有较好的一致性。差异表达miRNA的靶基因多富集在蛋白结合、离子结合、生物调节、细胞代谢等分子功能和生物功能上,多涉及代谢途径、磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路、EB病毒感染及丝裂原活化蛋白激酶信号通路等。结论 AD与银屑病之间存在多个差异表达的miRNA,其涉及多种生物功能及通路;PI3K/Akt通路、脂质代谢途径等通路在AD和银屑病的发生及病情演变...

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【文章目录】：
1 资料和方法
    1.1 高通量测序标本来源
    1.2 试剂与仪器
    1.3 高通量测序方法
        1.3.1 标本获取:
        1.3.2 总RNA提取:
        1.3.3 文库的构建与测序:
        1.3.4 测序数据分析和处理:
    1.4 实时荧光定量PCR验证
        1.4.1 标本来源:
        1.4.2 引物设计:
        1.4.3 实时荧光定量PCR检测:
    1.5 生物信息学分析
    1.6 统计学分析
2 结 果
    2.1 差异表达miRNA的筛查结果
    2.2 实时荧光定量PCR验证结果
    2.3 生物学分析结果
3 讨 论



本文编号：4016323