福建省非典型埃尔托霍乱弧菌的遗传多样性研究
发布时间:2018-06-24 13:41
本文选题:霍乱弧菌 + 非典型埃尔托型 ; 参考:《中国预防医学杂志》2015年12期
【摘要】:目的探索福建省非典型埃尔托霍乱弧菌(aEVC)的进化变迁规律,了解aEVC的变异株种类、基因特征,并分析不同类别变异株对霍乱流行趋势的影响。方法运用单基因片段分析技术,选择1962-2005年代表性O1群埃尔托霍乱菌株49株,对ctxB基因扩增产物进行序列测定和比对分析,确定ctxB基因型;同时对毒力因子tcpA和rstR基因分别进行古典型(Cl)和埃尔托型(El)特异的PCR扩增,确定其基因型别。结合ctxB、tcpA、rstR3种基因不同型别的组合形式,确定福建省aEVC菌株的多样性。结果1986年前菌株ctxB基因以埃尔托型B3型为主占92.00%(23/25),而1994年后菌株以古典型B1型为主占95.83%(23/24)。根据ctxB、rstR、tcpA3种基因不同型别的组合形式,1986年前菌株88.00%(22/25)表现为埃尔托型基因特征B3、El、El,1994年后菌株100.00%(24/24)表现为杂合型(Hybrid)变异株基因特征B1、El和(或)Cl、El。结论福建省霍乱菌株存在aEVC进化事件。ctxB、rstR、tcpA基因表现为B1、El和(或)Cl、El的杂合型变异株是福建省aEVC的主要特征型别,此类菌株于1994年后全面取代原来流行的埃尔托霍乱弧菌。不同血清型的aEVC变异株对菌株流行能力的影响不同,稻叶型埃尔托型菌株比杂合型流行时间要长,而小川型杂合型菌株比埃尔托型流行时间要持久。
[Abstract]:Objective to explore the evolutionary changes of atypical Vibrio cholerae (AEVC) in Fujian Province, to understand the species and gene characteristics of variant strains of AEVC, and to analyze the influence of different variant strains on the epidemic trend of cholera. Methods A single gene fragment analysis technique was used to determine the ctxB genotype by sequencing and comparing the ctxB gene amplification products from 49 representative O1 strains of Elto cholera from 1962 to 2005. At the same time, the virulence factor tcpA and rstR gene were amplified by paleotypic (Cl) and Elto type (El) specific PCR, respectively, and their genotypes were identified. The diversity of aEVC strains in Fujian Province was determined by combining the combination forms of different gene types of ctxBX tcpA rstR3. Results before 1986, 92.00% (23 / 25) of strain ctxB were Elto B3 type, while 95.83% (23 / 24) of the strains mainly belonged to the ancient B _ 1 type (23 / 24) after 1994. According to the combinations of three different types of genes, 88.00% (22 / 25) of the strains showed Elto type gene feature before 1986, 100.00% (24 / 24) of the strains showed hybrid variant gene characteristics B1El and (or) Cli El. after 1994. Conclusion the heterozygous variant of AEVC evolutional event. CtxBX rstRntcpA gene is the main characteristic type of AEVC in Fujian Province. This strain completely replaced the original prevalent Vibrio cholerae after 1994. Different serotype strains of aEVC had different influence on the epidemic ability of the strain. The rice leaf type of Elto type was longer than the heterozygous strain, while the Ogawa type of heterozygote was longer than the Elto type.
【作者单位】: 福建省疾病预防控制中心;福建省人兽共患病研究重点实验室;福建医科大学公共卫生学院教学基地;
【基金】:福建省自然科学基金(2014J01282,2012J01315)
【分类号】:R378.3
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7 ;[J];;年期
,本文编号:2061711
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