脱氢表雄酮诱导的多囊卵巢综合征模型大鼠的肠道菌群研究
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978上海交通大学学报(医学版)2019,39(9)JOURNALOFSHANGHAIJIAOTONGUNIVERSITY(MEDICALSCIENCE)Vol.39No.9Sep.201916SrRNA测序。对所有有效原始数据进行筛选,获得优化序列,进行操作分类单元(operationaltaxonomicunits,OTU)聚类。从各个OTU中挑选出丰度最高的一条序列,作为该OTU的代表序列。将该代表序列与核糖体数据库(RibosomalDatabaseProject,RDP)中已知物种的16SrRNA基因序列进行比对,从而对每个OTU进行物种归类。根据物种注释情况,统计每个样品中被注释到各分类水平上的序列数目。根据物种注释结果绘制物种组成柱形图,从而进行物种相对丰度分析。LEfSe分析(LDAEffectSize)采用线性判别分析(lineardiscriminantanalysis,LDA)来估算每个物种的丰度对2组之间差异的影响程度,找出影响2组之间产生显著差异的群落或物种,以LDA≥2.0为显著差异判定标准。通过R软件包绘制优势物种之间Spearman相关性热图,以发现优势物种之间重要的模式与关系。基于16SrRNA和参考序列数据库进行PICRUSt(phylogeneticinvestigationofcommunitiesbyreconstructionofunobservedstates),以较好地反映样品中的功能基因构成,从而预测基因功能。1.6统计学分析所有数据采用SPSS19.0软件进行分析。结果以x—±s表示。检验样本变量之间的方差齐性,多组间的均数比较采用单因素方差分析(One-WayANOVA)及t检验(Student'sttest)。P<0.05时被认为差异有统计学意义。2结果2.1大鼠体质量变化实验组大鼠连续28d皮下注射DHEA溶液,其体质量的增长情况与皮下注射PBS的对照组大鼠相比,差异无统计学意义(P>0.05,图1)。图12组大鼠体质量增长的情况Fig1Growthofbodyweightofratsfromtwogroups2.2大鼠动情周期改变在实验的第4周
析(One-WayANOVA)及t检验(Student'sttest)。P<0.05时被认为差异有统计学意义。2结果2.1大鼠体质量变化实验组大鼠连续28d皮下注射DHEA溶液,其体质量的增长情况与皮下注射PBS的对照组大鼠相比,差异无统计学意义(P>0.05,图1)。图12组大鼠体质量增长的情况Fig1Growthofbodyweightofratsfromtwogroups2.2大鼠动情周期改变在实验的第4周,2组大鼠的动情周期出现明显差异。与对照组大鼠相比,实验组大鼠的动情周期延长,动情周期明显紊乱(图2)。注:A.对照组;B.实验组。每组展示3只大鼠的动情周期代表图。动、前、间、后分别表示动情期、动情前期、动情间期、动情后期图22组大鼠动情周期的情况Fig2EstrouscyclesofratsfromtwogroupsAB
979http://xuebao.shsmu.edu.cn上海交通大学学报(医学版),2019,39(9)2.3大鼠卵巢质量及形态学改变实验组大鼠卵巢质量较对照组降低(图3A,P=0.010)。通过H-E染色可见,对照组大鼠卵巢皮质内存在黄体和各级卵泡,排卵前卵泡内可见卵丘及卵母细胞,卵泡形态较为规则(图3B)。而实验组大鼠卵巢形态出现明显改变,小窦卵泡增多,伴卵泡囊性扩张、卵泡壁颗粒细胞层减少、卵泡壁变薄等异常改变(图3C)。注:A.2组大鼠卵巢质量比较;B.对照组大鼠卵巢形态;C.实验组大鼠卵巢形态图32组大鼠卵巢质量及H-E染色情况Fig3OvarianweightandH-Estainingofratovariesintwogroups注:A.对照组、实验组内每只大鼠肠道菌群的相对丰度;B.2组大鼠肠道菌群的相对丰度图42组大鼠肠道菌群在属水平的相对丰度Fig4Relativeabundanceofgutmicrobiotaoftwogroupsofratsingenuslevel2.4大鼠肠道菌群的丰度变化在属水平,对照组内每只大鼠肠道菌群组成情况较为类似,而实验组中各大鼠间肠道菌群的相对丰度变化较大(图4A)。2组大鼠肠道菌群丰度较高的属依次为普雷沃菌属(Prevotella)、拟杆菌属(Bacteroides)、考拉杆菌属(Phascolarctobacterium)、乳杆菌属(Lactobacillus)及梭菌属(Clostridium)(图4B)。对比2组间大鼠肠道菌群的相对丰度发现,拟普雷沃菌属(Alloprevotella,P=0.040)及副萨特菌属(Parasutterella,P=0.009)的丰度差异有统计学意义(表1)。ABBCA储维薇,等脱氢表雄酮诱导的多囊卵巢综合征模型大鼠的肠道菌群研究
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