人感染禽流感病毒A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)株HA基因序列分析
发布时间:2021-02-08 16:33
目的测定本市首例人感染禽流感病毒A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)株HA基因序列,分析H7N9禽流感病毒HA基因特点。方法采用real-time PCR检测患者H7N9禽流感病毒核酸,RT-PCR扩增病毒HA基因后测定核苷酸序列。结果实验室确诊丽水首例人感染H7N9禽流感患者。测序得到H7N9禽流感病毒长度为1 683 bp的HA基因核苷酸全序。A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)与我国江浙沪分离株HA基因核苷酸和氨基酸序列相似性都比较高,分别为98.8%99.5%、98.9%99.5%;与浙江鸡分离株A/chicken/Zhejiang/C483/2013(H7N9)序列相似性最高。A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)与我国江浙沪H7N9病毒株HA基因序列均处于同一进化分支;与浙江外环境分离株A/environment/Hangzhou/34/2013(H7N9)进化关系最近;与浙江鸡分离株A/chicken/Zhejiang/C483/2013(H7N9)进化关系次之;与韩国野鸟分离株A/...
【文章来源】:中国卫生检验杂志. 2015,25(10)
【文章页数】:3 页
【部分图文】:
人感染H7N9禽流感病毒核酸real-timePCR扩增结果
?HA基因溯源结果对H7N9禽流感病毒HA基因序列进行溯源分析显示:丽水H7N9禽流感病毒分离株A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)与我国江浙沪病毒株HA基因序列均处于同一进化分支;与浙江人、外环境分离株A/Hangzhou/1/2013(H7N9)、A/environ-ment/Hangzhou/34/2013(H7N9)共聚类为一个独立的小分支,进化关系最近;与浙江鸡分离株A/chick-en/Zhejiang/C483/2013(H7N9)位于同一个亚分支,进化关系次之。与东北亚分离株特别是韩国野鸟分离株A/wildbird/Korea/A3/2011(H7N9)进化关系均比较近;与北美、欧洲禽流感进化距离最远(图2)。图2A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)禽流感病毒HA基因溯源分析3讨论甲型流感病毒有着极强的变异性,变异最为频繁,每隔十几年就会发生一次抗原性较大的变异而产生新的毒株[3],其中以血凝素蛋白HA进化最快,因为HA是中和抗体的靶子,病毒必须通过快速变异来逃避中和抗体的作用[5]。本研究获得的A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)HA基因全序列,符合以往H7亚型流感病毒的基因特征,HA基因与近几年在亚洲特别是我国流行的毒株氨基酸之间具有很高的相似性,说明这些毒株的来源不仅一致且H7N9禽流感病毒迄今为止变异较校其中位于HA0蛋白与病毒毒力相关的5个糖基化位点:30NGT、46NAT、249NDT、421NWT、493NNT(H3位置,下同)高度保守[6]。HA裂解位点为333PEIPKGR↓G340[7],与低致病性禽流感病毒(LPAIV)基因特征一致。HA蛋白受体结合位点发生Q226L变异[7],直接导致病毒对α-2,6受体位点结合能力增强,增加了与人类呼吸道上皮细胞的亲和力,更容易感染到人。本研究人感染H7N9禽流感确诊患者的流行病学调查资料显示其发病前有购买及宰杀禽类的接触史,感染来源明确,序列无论在相似性比?
【参考文献】:
期刊论文
[1]浙江省衢州市禽类职业暴露人群及外环境禽流感病毒监测分析[J]. 曹国平,占炳东,陈旭富,丰峰. 疾病监测. 2013(11)
[2]甲型流感病毒A/Lishui/01/2009(H1N1)株HA基因序列分析[J]. 雷永良,王晓光,柳付明,阙金莲,陈秀英. 中国卫生检验杂志. 2010(06)
[3]高致病性禽流感研究进展[J]. 郭元吉. 中华实验和临床病毒学杂志. 2006(02)
[4]浙江省人感染H7N9禽流感病毒的基因组序列分析[J]. 陈寅,茅海燕,李榛,徐昌平,高见,冯燕,王欣莹,严菊英,张严峻,卢亦愚. 中华流行病学杂志. 2013 (06)
本文编号:3024217
【文章来源】:中国卫生检验杂志. 2015,25(10)
【文章页数】:3 页
【部分图文】:
人感染H7N9禽流感病毒核酸real-timePCR扩增结果
?HA基因溯源结果对H7N9禽流感病毒HA基因序列进行溯源分析显示:丽水H7N9禽流感病毒分离株A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)与我国江浙沪病毒株HA基因序列均处于同一进化分支;与浙江人、外环境分离株A/Hangzhou/1/2013(H7N9)、A/environ-ment/Hangzhou/34/2013(H7N9)共聚类为一个独立的小分支,进化关系最近;与浙江鸡分离株A/chick-en/Zhejiang/C483/2013(H7N9)位于同一个亚分支,进化关系次之。与东北亚分离株特别是韩国野鸟分离株A/wildbird/Korea/A3/2011(H7N9)进化关系均比较近;与北美、欧洲禽流感进化距离最远(图2)。图2A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)禽流感病毒HA基因溯源分析3讨论甲型流感病毒有着极强的变异性,变异最为频繁,每隔十几年就会发生一次抗原性较大的变异而产生新的毒株[3],其中以血凝素蛋白HA进化最快,因为HA是中和抗体的靶子,病毒必须通过快速变异来逃避中和抗体的作用[5]。本研究获得的A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)HA基因全序列,符合以往H7亚型流感病毒的基因特征,HA基因与近几年在亚洲特别是我国流行的毒株氨基酸之间具有很高的相似性,说明这些毒株的来源不仅一致且H7N9禽流感病毒迄今为止变异较校其中位于HA0蛋白与病毒毒力相关的5个糖基化位点:30NGT、46NAT、249NDT、421NWT、493NNT(H3位置,下同)高度保守[6]。HA裂解位点为333PEIPKGR↓G340[7],与低致病性禽流感病毒(LPAIV)基因特征一致。HA蛋白受体结合位点发生Q226L变异[7],直接导致病毒对α-2,6受体位点结合能力增强,增加了与人类呼吸道上皮细胞的亲和力,更容易感染到人。本研究人感染H7N9禽流感确诊患者的流行病学调查资料显示其发病前有购买及宰杀禽类的接触史,感染来源明确,序列无论在相似性比?
【参考文献】:
期刊论文
[1]浙江省衢州市禽类职业暴露人群及外环境禽流感病毒监测分析[J]. 曹国平,占炳东,陈旭富,丰峰. 疾病监测. 2013(11)
[2]甲型流感病毒A/Lishui/01/2009(H1N1)株HA基因序列分析[J]. 雷永良,王晓光,柳付明,阙金莲,陈秀英. 中国卫生检验杂志. 2010(06)
[3]高致病性禽流感研究进展[J]. 郭元吉. 中华实验和临床病毒学杂志. 2006(02)
[4]浙江省人感染H7N9禽流感病毒的基因组序列分析[J]. 陈寅,茅海燕,李榛,徐昌平,高见,冯燕,王欣莹,严菊英,张严峻,卢亦愚. 中华流行病学杂志. 2013 (06)
本文编号:3024217
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