一株B亚型人呼吸道合胞病毒兰州分离株的全基因序列测定及其分子特征分析

发布时间：2021-05-22 18:32

　　人呼吸道合胞病毒（Human respiratory syncytial virus,HRSV）是每年引起婴幼儿和老年人下呼吸道感染的主要病毒性病原,在全球造成了高疾病负担,明确RSV流行毒株的遗传背景是其流行病学研究和预防控制的基础。为了解HRSV兰州分离株RSV B/LZ11/12的全基因组序列、分子结构特征及遗传变异情况,本研究对其全基因组进行扩增克隆和测序后,与GenBank中相关的参考毒株序列构建系统发生树并进行遗传进化及相似性分析。针对其主要蛋白F、G和SH的氨基酸进行了比对和差异分析,并对F蛋白的N-糖基化位点进行分析。结果表明B/LZ11/12与B亚型RSV的核苷酸同源性高达99%以上,其基因组全长15 275bp,具有RSV的所有结构特征。遗传进化分析显示,B/LZ11/12与B/GZ/13-730、B/England138/2016和SC2225同属于一个分支,提示亲缘关系最近。G基因遗传进化树表明该毒株属于RSV B亚型BA9基因型。主要氨基酸位点分析显示该毒株的G基因和F基因均具有一个特有的变化,即Glu87Gly和Val243Ala的氨基酸替换。F蛋白N-糖基... 

【文章来源】：病毒学报. 2019,35(04)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
材料与方法
    1毒株及菌株
    2主要试剂
    3引物的设计与合成
    4全基因扩增克隆及测序
    5序列编辑及分析
    6 F蛋白N-糖基化位点分析
结果
    1全基因组RT-PCR扩增克隆及测序
    2核苷酸序列及其同源性分析
    3全基因组系统发生树分析
    4 G基因系统发生树分析
    5核苷酸相似性分析
    6 F蛋白N-糖基化位点分析
讨论



本文编号：3201476