我国部分省份非01/0139群霍乱弧菌和气单胞菌的分子特征分析
发布时间:2021-06-23 05:43
非O1/O139群霍乱弧菌广泛的分布于自然界,尤其是水体及海产品中,可引起霍乱样腹泻的散发和局部暴发。然而,到目前为止,还缺少针对非O1/O139群霍乱弧菌的分子检测方法:同时,非O1/O139群霍乱弧菌的环境分离株中,毒力相关基因的分布特征及菌株之间的种群关系并不清楚。针对以上问题,我们对非O1/O139群霍乱弧菌进行了以下方面的研究。首先,我们建立了检测非O1/O139群霍乱弧菌的多重PCR和SYBR Green实时PCR方法。根据特异性条带(多重PCR)和特异性熔解温度(SYBR Green实时PCR),两种方法均能特异地检测非O1/O139群霍乱弧菌,并且能将霍乱弧菌从其它弧菌(5种)和肠道杆菌(3种)中鉴别出来;两种方法的检测下限分别为7×104cfu/ml(多重PCR)和7×102cfu/ml (SYBR Green实时PCR),且检测下限有统计学差异(P<0.05);对实时PCR的重复性检测,批内变异系数(CV)的范围是0.22%~0.92%,批间变异系数的范围是0.27%~1.41%;经370株非O1/O139群霍乱弧菌的检测,两种方法的一致性均为100%。其次,...
【文章来源】:中国疾病预防控制中心北京市
【文章页数】:90 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
非01/0139群霍乱弧菌中COeB的氨基酸序列比对结果
菌株和16株VSP-I/II阳性菌株,散布在最小生成树的各个部分,分属于不同的STs。??需要强调的是,除了两株0139群非产毒株,尽管分离年代和地区都不同,其余??不同STs的0139非产毒株组成了一个与0139产毒株不同的克隆簇(见图10)。??nnjuj?—??reference??/?-*■?9?/?01,ctxB?-.reference??■■?0139?.ctxS+巧?ferenco??!?0139.ctxB*.reference??jT*?Non*01/0139.ctxB*?.reference??vM?画圓I?Non*01/01?泌,cbB..refe巧nee??9?参说別?Non-01/0139.ctxB+.test??/?I?!?Non'01/〇,39,i:b(B-化到??驚呼峰裘??^.1/??若\|?/?一…?遂-??,?lAM?.-W??/?,?…皆’???…??参、<?二;、…??恣?W?一。,??注:图中毎一个圆代表一个ST,圆的面积反应菌株的数量,阴影部分代表一个簇。线段的长短代表不同STs之间位??点数量的不同
【参考文献】:
期刊论文
[1]实时聚合酶链反应检测O1群和O139群霍乱弧菌方法的建立及应用[J]. 王晓梅,王多春,谭海玲,钟豪杰,陈经雕,李柏生,柯昌文,闫梅英,张静,阚飙. 中华流行病学杂志. 2007(08)
[2]广州海珠地区非O1/非O139群霍乱弧菌流行状况调查及生物学特征研究[J]. 许少洪,李映霞,李少彤,吴琪,孙凤琪,黄芳,曾爱芳. 中华预防医学杂志. 2010 (12)
本文编号:3244352
【文章来源】:中国疾病预防控制中心北京市
【文章页数】:90 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
非01/0139群霍乱弧菌中COeB的氨基酸序列比对结果
菌株和16株VSP-I/II阳性菌株,散布在最小生成树的各个部分,分属于不同的STs。??需要强调的是,除了两株0139群非产毒株,尽管分离年代和地区都不同,其余??不同STs的0139非产毒株组成了一个与0139产毒株不同的克隆簇(见图10)。??nnjuj?—??reference??/?-*■?9?/?01,ctxB?-.reference??■■?0139?.ctxS+巧?ferenco??!?0139.ctxB*.reference??jT*?Non*01/0139.ctxB*?.reference??vM?画圓I?Non*01/01?泌,cbB..refe巧nee??9?参说別?Non-01/0139.ctxB+.test??/?I?!?Non'01/〇,39,i:b(B-化到??驚呼峰裘??^.1/??若\|?/?一…?遂-??,?lAM?.-W??/?,?…皆’???…??参、<?二;、…??恣?W?一。,??注:图中毎一个圆代表一个ST,圆的面积反应菌株的数量,阴影部分代表一个簇。线段的长短代表不同STs之间位??点数量的不同
【参考文献】:
期刊论文
[1]实时聚合酶链反应检测O1群和O139群霍乱弧菌方法的建立及应用[J]. 王晓梅,王多春,谭海玲,钟豪杰,陈经雕,李柏生,柯昌文,闫梅英,张静,阚飙. 中华流行病学杂志. 2007(08)
[2]广州海珠地区非O1/非O139群霍乱弧菌流行状况调查及生物学特征研究[J]. 许少洪,李映霞,李少彤,吴琪,孙凤琪,黄芳,曾爱芳. 中华预防医学杂志. 2010 (12)
本文编号:3244352
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