SARS冠状病毒检测寡核苷酸基因芯片的研制及应用
发布时间:2021-07-28 10:33
SARS冠状病毒(SARS-CoV)感染所引起的严重急性呼吸综合征(SARS),2003年冬春之际在我国以及世界上多个国家和地区的爆发流行,对人类健康、经济发展和社会稳定造成了严重的危害。早期、快速、准确的诊断,对于SARS的预防和隔离至关重要。目前常用的诊断措施包括病毒分离培养、免疫学方法、基于PCR的检测技术等等,但分别存在难以早期诊断、敏感度低、实施困难或假阳性高等缺陷。本课题研究采用基因芯片技术,探索对SARS冠状病毒感染的早期、敏感、准确和快速检测。 基因芯片是近年来兴起的基因检测新技术。特别是最近迅速发展的长链寡核苷酸基因芯片技术(60-70 mer Oligo Microarray),为从基因水平高度特异性的检测SARS-CoV提供了可能。本研究还采用一种全基因组的标记方法,与基因芯片检测的大规模、高通量特性相配合,为基因芯片在临床诊断中的应用做出了贡献。 本研究首先确立了长链寡核苷酸基因芯片实验的基本条件,通过采用几种不同的基质材料进行点样杂交,以获得最适合长链寡核苷酸点样的片基材料以及最适的点样浓度和特异性。进而确定了用于寡核苷酸芯片杂交检测所需要的最佳探...
【文章来源】:南方医科大学广东省
【文章页数】:99 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
种不同玻片固定率检测结果
玻片为固定率以及杂交后信噪比最高的片基材料。abCd图1一14种不同玻片固定率检测结果Fig.l一1Resultofirnrnobili乙时ionratioexPerimentof4differentslidesa.pely一L一lysineeoatedslideb.Co而ngCMT-GAPSslidee.U一Version01190slided.TelechemSuPerAmineslide图1一2四种不同玻片固定率检测荧光强度、信号强度、背景值Fig.1一2Floreseentdensity,signalandbaekgroundofirnrnobiliZationratioexPerimentof4differentslidese.poly一L一lysineeoatedslideb.Co而ngCMT-GAPSslidee.U一Version01190slided.TeleehemSuPe。勺rnineslide
度探针点样的pely一L一lysine处理玻片固定率检测结果浓度分ZlJ为0.25林g/林L,0.5林g/林L,l林g/卜L,1.5林g/林L,2林g/卜L,2.5林留匹的70mer寡核普酸探针点样后杂交后结果如图1一3所示,探针浓度与荧光强度的相关关系曲线如图1一所示。由图中可以看出用poly一L一lysine做片基,探针的固定率有随探针浓度增加而升高的趋势,探针浓度在1林岁林L以下时,固定率非常低,在1林岁林L~2.5林创林L之间时,固定率显著升高,并随探针浓度的递增呈逐步升高,在2.5抖留林L左右基本达到饱和。def图1一36种不同浓度探针点样固定率检测结果Fig.l一3Hybridizationresultsof而eroaJ汀aysPriniedby6differentProbeeoncentrationa.2.5林g/林Lb.2抖g/林L,e.1.5林g/林L,d.1林g/林L,e.0.5林g/林L
【参考文献】:
期刊论文
[1]SARS患者及其医护人员血中特异IgG抗体变化规律的初步研究[J]. 徐国宾,陆海英,李杰,李勇华,冯珍如,霍娜,王广发,赵振东,张国华,闫存玲,李海霞,高晓明,徐小元,王贵强,庄辉. 北京大学学报(医学版). 2003(S1)
[2]严重急性呼吸综合征病毒的形态与发生[J]. 广东省防治非典型肺炎科技攻关专题组,张勤奋,崔金明,黄小俊,林伟,谭冬艳,徐洁薇,杨艺峰,张景强,张欣,李晖,郑焕英,陈秋霞,郑夔,鄢心革,万卓越,黄吉城. 广东医学. 2003(S1)
[3]SARS病变组织细胞凋亡检测及其意义[J]. 张庆玲,丁彦青,贺莉,王蔚,张进华,王慧君,蔡俊杰,耿舰,陆药丹,罗元龙. 第一军医大学学报. 2003(08)
[4]五种SARS冠状病毒-IgG抗体检测试剂的比较[J]. 万卓越,李杰,谢展鸿,鄢心革,张欣,李晖,周惠琼,黄平,方苓,陈秋霞. 华南预防医学. 2003(04)
[5]严重急性呼吸综合征患者血清中SARS相关抗体的特异性研究[J]. 赵军,陈昊,郑宇,李伯安,何卫平,李靖,高蓉,程云. 第二军医大学学报. 2003(06)
[6]用于SARS冠状病毒检测的60mer寡核苷酸基因芯片的设计及应用[J]. 石嵘,马文丽,吴清华,张宝,宋艳斌,郭秋野,肖维威,王艳,郑文岭. 科学通报. 2003(12)
[7]严重急性呼吸综合征的病理改变[J]. 陈咏仪,郑坚,王瑞琳,杜家辉,谢文杰,罗颖业,许伯均. 中华病理学杂志. 2003(03)
[8]广东省传染性非典型肺炎病例的SARS冠状病毒分离株的分子生物学鉴定[J]. 陈秋霞,黄吉城,郑夔,周惠琼,郑焕英,鄢心革,黄平,刁丽梅,张万里,陈经雕. 华南预防医学. 2003(03)
[9]间接免疫荧光抗体试验在传染性非典型肺炎诊断中的应用[J]. 方立群,张泮河,杨宝安,吴晓明,赵秋敏,刘玮,刘洪,邓永强,詹琳,韩伟国,吕富双,吴劲松,杨红,祝庆余,曹务春. 中华流行病学杂志. 2003(06)
[10]反转录巢式PCR方法检测SARS冠状病毒[J]. 王艳,马文丽,宋艳斌,肖维威,张宝,黄海,王洪敏,马晓冬,郑文岭. 第一军医大学学报. 2003(05)
本文编号:3307749
【文章来源】:南方医科大学广东省
【文章页数】:99 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
种不同玻片固定率检测结果
玻片为固定率以及杂交后信噪比最高的片基材料。abCd图1一14种不同玻片固定率检测结果Fig.l一1Resultofirnrnobili乙时ionratioexPerimentof4differentslidesa.pely一L一lysineeoatedslideb.Co而ngCMT-GAPSslidee.U一Version01190slided.TelechemSuPerAmineslide图1一2四种不同玻片固定率检测荧光强度、信号强度、背景值Fig.1一2Floreseentdensity,signalandbaekgroundofirnrnobiliZationratioexPerimentof4differentslidese.poly一L一lysineeoatedslideb.Co而ngCMT-GAPSslidee.U一Version01190slided.TeleehemSuPe。勺rnineslide
度探针点样的pely一L一lysine处理玻片固定率检测结果浓度分ZlJ为0.25林g/林L,0.5林g/林L,l林g/卜L,1.5林g/林L,2林g/卜L,2.5林留匹的70mer寡核普酸探针点样后杂交后结果如图1一3所示,探针浓度与荧光强度的相关关系曲线如图1一所示。由图中可以看出用poly一L一lysine做片基,探针的固定率有随探针浓度增加而升高的趋势,探针浓度在1林岁林L以下时,固定率非常低,在1林岁林L~2.5林创林L之间时,固定率显著升高,并随探针浓度的递增呈逐步升高,在2.5抖留林L左右基本达到饱和。def图1一36种不同浓度探针点样固定率检测结果Fig.l一3Hybridizationresultsof而eroaJ汀aysPriniedby6differentProbeeoncentrationa.2.5林g/林Lb.2抖g/林L,e.1.5林g/林L,d.1林g/林L,e.0.5林g/林L
【参考文献】:
期刊论文
[1]SARS患者及其医护人员血中特异IgG抗体变化规律的初步研究[J]. 徐国宾,陆海英,李杰,李勇华,冯珍如,霍娜,王广发,赵振东,张国华,闫存玲,李海霞,高晓明,徐小元,王贵强,庄辉. 北京大学学报(医学版). 2003(S1)
[2]严重急性呼吸综合征病毒的形态与发生[J]. 广东省防治非典型肺炎科技攻关专题组,张勤奋,崔金明,黄小俊,林伟,谭冬艳,徐洁薇,杨艺峰,张景强,张欣,李晖,郑焕英,陈秋霞,郑夔,鄢心革,万卓越,黄吉城. 广东医学. 2003(S1)
[3]SARS病变组织细胞凋亡检测及其意义[J]. 张庆玲,丁彦青,贺莉,王蔚,张进华,王慧君,蔡俊杰,耿舰,陆药丹,罗元龙. 第一军医大学学报. 2003(08)
[4]五种SARS冠状病毒-IgG抗体检测试剂的比较[J]. 万卓越,李杰,谢展鸿,鄢心革,张欣,李晖,周惠琼,黄平,方苓,陈秋霞. 华南预防医学. 2003(04)
[5]严重急性呼吸综合征患者血清中SARS相关抗体的特异性研究[J]. 赵军,陈昊,郑宇,李伯安,何卫平,李靖,高蓉,程云. 第二军医大学学报. 2003(06)
[6]用于SARS冠状病毒检测的60mer寡核苷酸基因芯片的设计及应用[J]. 石嵘,马文丽,吴清华,张宝,宋艳斌,郭秋野,肖维威,王艳,郑文岭. 科学通报. 2003(12)
[7]严重急性呼吸综合征的病理改变[J]. 陈咏仪,郑坚,王瑞琳,杜家辉,谢文杰,罗颖业,许伯均. 中华病理学杂志. 2003(03)
[8]广东省传染性非典型肺炎病例的SARS冠状病毒分离株的分子生物学鉴定[J]. 陈秋霞,黄吉城,郑夔,周惠琼,郑焕英,鄢心革,黄平,刁丽梅,张万里,陈经雕. 华南预防医学. 2003(03)
[9]间接免疫荧光抗体试验在传染性非典型肺炎诊断中的应用[J]. 方立群,张泮河,杨宝安,吴晓明,赵秋敏,刘玮,刘洪,邓永强,詹琳,韩伟国,吕富双,吴劲松,杨红,祝庆余,曹务春. 中华流行病学杂志. 2003(06)
[10]反转录巢式PCR方法检测SARS冠状病毒[J]. 王艳,马文丽,宋艳斌,肖维威,张宝,黄海,王洪敏,马晓冬,郑文岭. 第一军医大学学报. 2003(05)
本文编号:3307749
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