沙门氏菌焦磷酸测序与分子分型溯源研究

发布时间：2017-05-06 16:16

  本文关键词：沙门氏菌焦磷酸测序与分子分型溯源研究，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：本研究根据肠道沙门氏菌、肠炎沙门氏菌和鼠伤寒沙门氏菌的特异序列,分别设计扩增引物和测序引物,建立焦磷酸测序检测方法。采用特异性引物对目标片段进行PCR扩增。然后制备单链模板并利用测序引物进行焦磷酸测序。结果表明,24株不同血清型的肠道沙门氏菌、16株肠炎沙门氏菌和6株鼠伤寒沙门氏菌分别扩增出81bp、176bp和131bp的片段,而阴性对照菌株均未扩增。焦磷酸测序结果进行BLAST比对表明,可以将如下100%匹配的碱基序列作为肠道沙门氏菌、肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌的判定标准：GCCTGTGGGT ACTTCTCCTG CCAGTATAAT, CCTGTTGTCT GCTCACCATT CGCCAGCCAC, TACAACCGGA GTGCACATTA ATCCCGCAGC。焦磷酸测序法是一种快速、准确的检测方法,可应用于食品中肠道沙门氏菌、肠炎沙门氏菌和鼠伤寒沙门氏菌的快速检测。
【关键词】：肠道沙门氏菌 肠炎沙门氏菌 鼠伤寒沙门氏菌 焦磷酸测序
【学位授予单位】：大连工业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R378
【目录】：

• 摘要4-5
• Abstract5-8
• 第一章 沙门氏菌概述8-20
• 1.1 沙门氏菌的分类与命名8-12
• 1.1.1 沙门氏菌分类命名的发展史8-11
• 1.1.2 现行的沙门氏菌属分类及命名原则11-12
• 1.2 沙门氏菌属特征12-16
• 1.2.1 形态学特征12
• 1.2.2 培养特征12-13
• 1.2.3 生理生化特征13
• 1.2.4 抗原特征13-15
• 1.2.5 噬菌体特征15-16
• 1.3 沙门氏菌病及发病机理16-20
• 1.3.1 流行病学16-17
• 1.3.2 发病机制17-18
• 1.3.3 感染症状18-20
• 第二章 焦磷酸测序检测技术与DiversiLab系统分子分型技术20-32
• 2.1 焦磷酸测序检测技术原理20-25
• 2.1.1 简介20
• 2.1.2 测序原理20-22
• 2.1.3 工作流程22-25
• 2.2 DiversiLab系统分子分型技术25-32
• 2.2.1 简介26
• 2.2.2 系统原理26-27
• 2.2.3 操作流程27
• 2.2.4 实验材料27-28
• 2.2.5 系统硬件28-29
• 2.2.6 系统软件29-31
• 2.2.7 技术特点31-32
• 第三章 焦磷酸测序检测肠道沙门氏菌、肠炎沙门氏菌和鼠伤寒沙门氏菌32-42
• 3.1 材料和方法32-36
• 3.2 结果36-42
• 第四章 DiversiLab系统沙门氏菌分子分型溯源方法的建立42-48
• 4.1 材料和方法42-44
• 4.2 结果与分析44-46
• 4.3 讨论46-48
• 第五章 结论48-49
• 参考文献49-51
• 致谢51

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 李秀娟;白萍;高伟利;李丽婕;徐保红;田会芳;;短片段基因序列测定检测沙门菌[J];现代预防医学;2010年20期

2 张晓丹;武海萍;陈之遥;周国华;;碱基序列标记法结合焦磷酸测序测定不同来源基因表达量[J];分析化学;2009年08期

3 汪维鹏;武海萍;周国华;;焦测序法检测禽流感病毒[J];分析化学;2008年06期

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1 杨芳;沙门菌条码基因研究及焦磷酸测序快速鉴定[D];河北师范大学;2011年

  本文关键词：沙门氏菌焦磷酸测序与分子分型溯源研究，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：348747