转录因子FOXM1的核酸适配体筛选与应用
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【摘要】:人类FOXM1蛋白属于Forkhead Box(Fox)转录因子家族,到目前为止这个家族在人类基因组中拥有至少50个成员,分别参与调节了细胞的分化、增殖、代谢与凋亡等生理过程,同时还对肿瘤发生和发展具有重要意义。FOXM1是一个与细胞增殖相关的转录因子,它被发现在人类的多种肿瘤细胞中都存在较高的表达水平,表明FOXM1与多种癌症的发生密切相关,如肝癌、肺癌、前列腺癌和乳腺癌等。因此,对FOXM1的深入研究将有助于进一步揭示肿瘤发生的发病机理,并为抗肿瘤药物的研发提供可能的新靶点。 针对蛋白功能研究,目前传统方法多采用抗体免疫手段。近年来核酸适配体在生物分析、疾病诊断、治疗、药物筛选等方面的应用引起了人们极大的兴趣,以核酸适配体取代抗体利用ELISA和流式细胞技术检测蛋白质的表达,可以比使用抗体获得更高的灵敏度。同时核酸适配体可以通过核酸化学方法进行制备,经过相应的修饰及生物功能化,能够达到对生物大分子、细胞等生物靶标的选择性检测、定位和其生物功能的调控。由于具有以上特点,核酸适配体在生物医学基础研究和临床诊断与治疗方面显示出巨大的应用前景。 本文以重组的GST-FOXM1融合蛋白作为靶蛋白,GST蛋白作为反筛蛋白,以包含有77个碱基的随机单链DNA寡核酸库作为初始库,经过7轮筛选,获得了1条与靶蛋白FOXM1高特异性与高亲和力结合的单链DNA核酸适配体JX42,该适配体与FOXM1的解离常数Kd达到225nM。进一步研究发现核酸适配体JX42在复杂体系中也可以特异性地识别FOXM1。因此利用该核酸适配体能够高特异性、高亲和性地结合FOXM1蛋白的这一特点,把此核酸适体发展为研究FOXM1的有力工具,并且可以发展成为一种用于研究与FOXM1相关的人类恶性肿瘤及其他疾病的靶向探针。
【关键词】:核酸适配体 FOXM1 SELEX 特异性识别
【学位授予单位】:湖南大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2013
【分类号】:R3416
【目录】:
- 摘要5-6
- Abstract6-9
- 第1章 绪论9-23
- 1.1 核酸适配体简介9
- 1.2 SELEX 技术及其基本原理9-11
- 1.3 核酸适配体的筛选方法11-15
- 1.3.1 基于毛细管电泳的 SELEX(CE-SELEX)12
- 1.3.2 硝酸纤维素膜作为分离介质的筛选12
- 1.3.3 基于亲和色谱和磁珠的筛选12-13
- 1.3.4 基于 FACS (Fluorescence-Activated Cell Sorting)的体外筛选13-14
- 1.3.5 基于微流控芯片的筛选14-15
- 1.4 核酸适配体的特征以及在生物医学领域的应用15-20
- 1.4.1 核酸适配体的特征15-16
- 1.4.2 核酸适配体在生物医学领域的应用16-20
- 1.5 转录因子 FOXM1 概述20-21
- 1.6 本论文拟开展的研究工作21-23
- 第2章 GST-FOXM1 DBD 融合蛋白及 GST 蛋白的原核表达与纯化23-34
- 2.1 前言23-24
- 2.2 实验仪器与材料24-26
- 2.3 实验方法26-31
- 2.3.1 pGEX-4T-1-FOXM1(220-355 aa)重组质粒的鉴定26-28
- 2.3.2 GST-FOXM1DBD 融合蛋白与 GST 蛋白的表达、提取与纯化28-31
- 2.4 实验结果与讨论31-33
- 2.4.1 重组质粒 pGEX-4T-1- FOXM1(220-355 aa)的鉴定和转化31-32
- 2.4.2 GST-FOXM1DBD 融合蛋白与 GST 蛋白的表达、提取与纯化32-33
- 2.5 本章小结33-34
- 第3章 转录因子 FOXM1 DBD 核酸适配体的筛选34-43
- 3.1 前言34-35
- 3.2 实验仪器和材料35-36
- 3.3 实验方法36-39
- 3.3.1 FOXM1 DBD 蛋白核酸适配体的筛选36-38
- 3.3.2 荧光显微镜法检测库的富集情况38
- 3.3.3 连接、转化、克隆和测序38-39
- 3.4 结果与讨论39-42
- 3.4.1 筛选过程最佳循环数的确定39-40
- 3.4.2 富集情况的检测40-41
- 3.4.3 克隆与测序结果41-42
- 3.5 本章小结42-43
- 第4章 核酸适配体 JX42 对转录因子 FOXM1 识别的初步研究43-52
- 4.1 前言43-44
- 4.2 实验仪器和材料44
- 4.3 实验方法44-48
- 4.3.1 适配体 JX42 与 FOXM1-DBD 结合亲和力的考察44-46
- 4.3.2 适配体 JX42 与 FOXM1 结合特异性的考察46
- 4.3.3 231 细胞“免疫”荧光染色46-48
- 4.4 结果与讨论48-50
- 4.4.1 适配体 JX42 与 GST-FOXM1-DBD 的解离平衡常数值的测定48
- 4.4.2 适配体 JX42 与纯蛋白 GST-FOXM1-DBD 结合亲和力和特异性检测48-49
- 4.4.3 适配体 JX42 与细胞裂解物中 FOXM1 结合的亲和力和特异性的检测49
- 4.4.4 231 细胞“免疫”荧光染色49-50
- 4.5 本章小结50-52
- 结论与展望52-54
- 参考文献54-60
- 附录 A 攻读学位期间所发表的学术论文60-61
- 致谢61
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本文编号:351709
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