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申克孢子丝菌PalI和PalI样蛋白生物信息学分析

发布时间:2022-02-19 19:09
  为初步了解申克孢子丝菌Sporothrixschenckii基因组中真菌特有蛋白PalI和PalI样蛋白的生物学特征,利用在线生物信息学分析软件,对两蛋白理化特征、功能域、二级结构、抗原表位等进行分析预测。发现两蛋白理论分子量分别为24.6kDa和75.6kDa,等电点均偏碱性;属于同一蛋白家族,具有相同的功能域和多个PKC磷酸化位点;两蛋白在近氨基端区域相似度较高,并与其他模式真菌中同源蛋白有很高相似度;同时,两蛋白都有跨膜区,氨基端序列三级结构极为相似,并有丰富的抗原表位。通过生物信息学分析对申克孢子丝菌PalI和PalI样蛋白生物学特征有了初步的认识,为后续实验研究提供有力支持。 

【文章来源】:菌物学报. 2019,38(08)北大核心CSCD

【文章页数】:9 页

【文章目录】:
1 材料与方法
    1.1 序列来源
    1.2 生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 基本理化特征
    2.2 蛋白结构
    2.3 功能域及修饰
    2.4 亚细胞定位
    2.5 抗原表位
3 讨论



本文编号:3633461

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