小鼠NFATc1相互作用蛋白功能及KEGG通路分析

发布时间：2022-04-23 08:41

　　目的:利用生物信息学方法对小鼠NFATc1及相关蛋白功能进行预测与分析,为探讨NFATc1生物学功能及作用机制提供借鉴。方法:利用在线数据库STRING,选取系统打分高于0.800的20种蛋白质与NFATc1构建蛋白相互作用网络图,并对该蛋白集合进行后续分析;采用DAVID在线分析工具对以上蛋白进行GO功能富集和KEGG信号通路分析。结果:GO富集分析显示,该蛋白集合参与CaN/NFAT信号通路、转录正调控、JUN蛋白磷酸化、基因表达正调控等生物学过程。具体分子功能主要是结合转录因子、钙依赖蛋白丝氨酸/苏氨酸磷酸酶活性、JUN蛋白激酶活性及RNA聚合酶Ⅱ核心启动子近端序列特异性结合DNA等;KEGG信号通路分析显示,该蛋白集合主要富集于破骨细胞分化代谢、Wnt信号通路、T细胞受体信号通路、B细胞受体信号通路等。结论:NFATc1及其相关蛋白生物学功能具有广泛性,其原因可能与参与多种细胞信号转导通路相关。 

【文章页数】：4 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 方法
2 结果
    2.1 构建蛋白质相互作用网络图
    2.2 GO富集分析
    2.3 KEGG信号通路分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]核因子κB受体活化因子通过TRPC6?NFATc1信号通路介导足细胞损伤[J]. 张鸿,梁顺,杜玥,窦曹帅,张丽,谈锦萍,刘双信,梁馨苓,章斌.  实用医学杂志. 2019(01)
[2]NFATc1对裸鼠上皮性卵巢癌移植瘤脉管生成的影响[J]. 龙丽,段赵宁,蔡海贝,唐良萏.  中国病理生理杂志. 2016(02)



本文编号：3646908