结核分枝杆菌Wag31蛋白的生物信息学分析

发布时间：2023-11-16 19:50

　　目的运用生物信息学方法预测分析结核分枝杆菌Rv2145c基因编码蛋白Wag31的结构与功能。方法由NCBI数据库中获得Rv2145c基因及蛋白Wag31的编码序列,运用ProtParam及ProtScale对Wag31蛋白的基本理化特性及亲疏水性进行预测分析;运用NetPhos、TMHMM及SignalP 4.1分析Wag31的磷酸化位点、跨膜区结构及信号肽;分别运用SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred以及SYFPEITHI等工具预测Wag31蛋白的二级、三级结构以及抗原表位;运用STRING预测Wag31蛋白的相互作用蛋白,并进行富集分析。结果细胞壁合成蛋白Wag31由260个氨基酸组成,分子式为C₁₂₀₀H₁₉₄₆N₃₇₀O₄₁₀S₅,相对分子质量28.277 18×10³,属于不稳定蛋白,具有亲水性;蛋白质二级结构分析显示,无规则卷曲(Cc)占24.23%,α-螺旋(Hh)、β-折叠(Ee)和β-转角(Tt)含量分别占73.08%、1....

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【文章目录】：
材料与方法
    1 材料
    2 方法
        2.1 Wag31蛋白的基本理化性质分析
        2.2 Wag31蛋白的信号肽、跨膜区及磷酸化位点预测
        2.3 Wag31蛋白结构预测
        2.4 Wag31蛋白的抗原表位预测
        2.5 Wag31蛋白质相互作用蛋白预测及富集分析
结 果
    1 Wag31蛋白的理化性质
    2 Wag31蛋白的亲疏水性
    3 Wag31蛋白信号肽、跨膜区及磷酸化位点的预测
    4 Wag31蛋白的二级结构预测
    5 Wag31蛋白的三级结构
    6 Wag31蛋白的抗原表位
    7 Wag31相互作用蛋白预测及富集分析
讨 论



本文编号：3864469