东南亚地区寨卡病毒的流行及结构蛋白分子进化特征分析

发布时间：2023-12-24 16:43

　　目的分析寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)在东南亚地区的感染传播情况,探讨其分子水平上的进化特征。方法用关键词和主题词检索ZIKV在东南亚地区暴发感染流行情况。在GenBank中获取ZIKV东南亚病毒株全基因序列,采用BIOEDIT软件进行比对;利用MEGA 7. 0软件绘制系统进化树;将结构蛋白核苷酸翻译获得其相应的氨基酸序列,分析突变情况;统计不同株型间结构蛋白核苷酸突变和氨基酸替代位点;预测包膜蛋白第三结构域(envelop domainⅢ,ED-Ⅲ)的二级结构。结果 ZIKV在东南亚国家均有血清学感染或回顾性检测阳性报道,其中越南、泰国和新加坡ZIKV感染病例较多,疾病负担较为严重。系统进化树表明,东南亚ZIKV株均属于亚洲型,2016年新加坡株(序列号:KY241788)与2015年巴西株亲缘关系最近,1966年分离的马来西亚株与其他东南亚株亲缘关系较远。东南亚ZIKV各株型间衣壳蛋白(capsid protein,C)的碱基突变点为22处,突变率为6. 36%,造成非同义氨基酸突变点为19处,突变率为16. 52%。前膜蛋白(pre-membrane protein...

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【文章目录】：
1 资料与方法
    1.1 ZIKV东南亚流行情况分析
    1.2 东南亚ZIKV流行毒株分子进化分析
    1.3 结构蛋白突变分析及E蛋白第三结构域（enve-lop domainⅢ，ED-Ⅲ）二级结构预测
2 结果
    2.1 ZIKV东南亚流行情况
    2.2 东南亚ZIKV流行毒株分子进化分析
    2.3 结构蛋白突变分析及ED-Ⅲ二级结构预测
3 讨论



本文编号：3874909