共生菌对荷瘤小鼠肺泡巨噬细胞基因表达的调控作用

发布时间：2024-02-04 17:05

　　目的探讨共生菌群对荷瘤小鼠肺泡巨噬细胞(AM)基因表达的调控作用。方法分离纯化共生菌缺失的荷瘤小鼠及共生菌正常的荷瘤小鼠AM,利用基因芯片技术筛选差异表达的基因并进行生物信息学分析。结果分选后的AM细胞纯度可达98%,共生菌缺失荷瘤小鼠与正常荷瘤小鼠相比较,AM细胞中差异性表达基因共有353个(变化倍数≥2),上调基因171个,下调基因182个;差异表达基因的基因分类(GO)主要为细胞凋亡、细胞增殖、细胞分化、信号传导、血管生成等;KEGG通路主要为氮素代谢、趋化因子信号、TGF-β信号及肿瘤通路等;M2型巨噬细胞特异性基因CCL24、Arg1、Retnla及IL-13等在共生菌缺失荷瘤小鼠AM细胞中表达上调。结论共生菌可以调控荷瘤小鼠AM细胞的基因表达,包括CCL24、Arg1、Retnla及IL-13等基因,差异表达基因与多个GO分类和KEGG通路密切相关。

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【部分图文】：

图1共生菌缺失对荷瘤小鼠肺泡巨噬细胞基因表达的影响注:WT+LLC为共生菌正常的荷瘤小鼠;Abx+LLC为共生菌缺失的荷瘤小鼠

图2共生菌缺失荷瘤小鼠肺泡巨噬细胞差异表达基因的功能分析

血管生成、分泌、细胞分化、细胞增殖、对刺激的反应性、运动、信号、多器官过程及免疫系统过程等(图2A、图2B)。KEGG通路分析结果表明，共生菌缺失后荷瘤小鼠肺泡巨噬细胞差异性表达基因主要与氮素代谢、趋化因子信号通路、TGF-β信号通路、肿瘤通路、细胞因子－细胞因子受体相互作用等信....

图3肺泡巨噬细胞中M1和M2型巨噬细胞特异性基因的表达情况注:WT+LLC为共生菌正常的荷瘤小鼠;Abx+LLC为共生菌缺失的荷瘤小鼠

本文编号：3895562