人呼吸道合胞病毒兰州株全基因组序列测定及分析

发布时间：2024-04-21 23:51

　　目的为了解人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytium virus,HRSV)兰州株(HRSV LZ01/09)的遗传特征及分子进化规律,进一步丰富RSV基因组数据库,对HRSV LZ01/09的全基因组序列进行测定及分析。方法通过RT-PCR法对HRSV LZ01/09全基因组片段进行扩增及序列测定,利用分子生物学软件对测序结果进行拼接,并与GenBank登录的RSV实验参比株和各基因型代表株进行分子进化分析。结果 HRSV LZ01/09全基因组全长为15 204 bp,基因组的结构为NS1-NS2-N-P-M-SH-G-F-M2-1-M2-2-L,与报道的RSV实验参比株相同;全基因组序列比对分析表明,HRSV LZ01/09兰州株基因组序列与RSV RSS2株的同源性最高,为96. 7%,与其他RSV-A亚型毒株同源性次之,为94. 9%～95. 2%,与RSV-B亚型9320株同源性最低,为80. 9%;依据RSV-G基因的第2个可变区进行系统进化树分析,HRSV LZ01/09兰州株基因组与NA1病毒分离株属于同一个分支。结论 HRSV LZ01...

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 毒株、载体及细胞
    1.2 主要试剂及仪器
    1.3 引物设计及合成
    1.4 目的基因的扩增
    1.5 克隆质粒的构建
    1.6 序列分析及病毒全基因组和G基因的高变区系统进化树分析
    1.7 核苷酸和氨基酸变异位点的分布
2 结果
    2.1 HRSV LZ01/09株基因组的分段扩增、测序及拼接
    2.2 HRSV LZ01/09株基因组的结构特征
    2.3 HRSV LZ01/09株基因组全序列系统进化树分析
    2.4 HRSV LZ01/09株基因组全序列同源性分析
    2.5 核苷酸和氨基酸变异位点的分布
    2.6 HRSV LZ01/09株基因型分析
3 讨论



本文编号：3961629