结核分枝杆菌RodA蛋白结构特征的生物信息学分析

发布时间：2024-10-17 13:02

　　 运用生物信息学软件分析及预测结核分枝杆菌Rv0017c基因编码蛋白RodA的结构与功能。采用NCBI、ExPASY、PSORTb等在线工具分析结核分枝杆菌Rv0017c的基因信息,分析其保守域、理化性质和亚细胞定位;利用SOPMA、Vaxijen v2.0等软件预测RodA蛋白的二、三级结构和抗原性。结果表明:Rv0017c基因全长1 410 bp,编码469个氨基酸,分子量为50 610.83,蛋白序列具有高度的保守性。RodA的二级结构中,α螺旋所占比例最多,其次是C无规卷曲结构,而β折叠相对占比很少。RodA并非MTB发挥毒力效应的蛋白因子,但具有较高的抗原性。结论为RodA蛋白序列保守稳定,在结核菌的膜壁形成中发挥巨大作用,且具有较高的抗原性,可作为治疗耐药结核的新靶标。

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【部分图文】：

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武汉轻工大学学报２０１９年图３ＲｏｄＡ的三级结构预测模型胞极性和膜相关细胞器的分布等方面发挥着重要的作用［１４］。亚细胞定位表明，ＲｏｄＡ位于细胞质膜上，且有１１次跨膜结构。通过二、三级结构预测，验证该蛋白具有复杂性的结构，为ＲｏｄＡ作为下一代抗生素的备选靶标提供了理论依据［１５....

本文编号：4008042