河南省柯萨奇病毒A组16型VP4基因特征分析

发布时间：2017-05-29 08:02

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【摘要】：目的分析河南省手足口病标本分离柯萨奇病毒A组16型(coxsachievirus A 16,CVA16)VP4的基因特征,并比较VP4与VP1遗传进化分析的差异。方法对分离自河南省手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)患儿的8株CVA16,采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法进行VP4区域扩增并对扩增产物进行测序,用分子生物学软件ATGC进行序列拼接,Bioedit比对剪齐,用MEGA 4.0软件进行同源性分析,并与已报道的CVA16标准株序列构建基因进化树。结果河南省8株毒株VP4核苷酸同源性为91.3%~98.1%、氨基酸同源性为100.0%,与国际原型株CA16/G10/RSA/1951(A型)比对,VP4核苷酸同源性为79.7%~82.6%,氨基酸同源性为100.0%;与B1a、B1b和B2型代表株核苷酸同源性分别为92.3%~95.7%、92.8%~98.6%、88.9%~91.8%,氨基酸同源性均为100.0%。河南省分离的CVA16毒株均属于B1亚型,有B1a和B1b两个进化支共同存在和循环,但VP4与VP1的进化树分型不完全一致。结论 VP4基因不能作为CVA16病毒基因亚型分型的依据。
【作者单位】： 河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所;
【关键词】： 柯萨奇病毒A组型 VP 进化树
【基金】：河南省医学科技攻关计划重大项目(201001015) 河南省医学科技攻关计划普通项目(2011020175)
【分类号】：R373
【正文快照】： 目前已知的人类肠道病毒(human enterovir-us)有119个型别,肠道病毒(enterovirus)型别众多,引起人类的疾病也多种多样[1]。VP1区域是进行人肠道病毒分型的主要依据,依据VP1进行基因进化树分型可以将肠道病毒分为A、B、C、D四组[2]。有研究显示在肠道病毒A组内,用VP4基因进行遗

【参考文献】

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【共引文献】

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【相似文献】

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本文编号：404437