沙眼衣原体多态膜蛋白PmpF基因克隆及生物信息学分析

发布时间：2017-09-22 17:14

  本文关键词：沙眼衣原体多态膜蛋白PmpF基因克隆及生物信息学分析

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【摘要】：目的克隆沙眼衣原体的多态膜蛋白PmpF基因,分析其生物学特征。方法以沙眼衣原体L2菌株DNA为模板,PCR扩增PmpF基因,克隆后测序,采用生物信息软件、数据库对其进行同源性比对,并分析其编码蛋白的主要化学特征、结构功能以及B细胞抗原表位。结果 PCR扩增实验株沙眼衣原体PmpF基因核苷酸序列长度为3 099bp,该菌株与同一生物型同源性≥99.97%,与不同生物型同源性89.32%;与同一生物型氨基酸序列同源性≥99.90%,与不同生物型同源性达89.25%。编码蛋白的分子质量单位为112.538 2ku,等电点为9.15,该蛋白具有信号肽和2个结构域。对蛋白质的二级结构和柔性区、氨基酸的亲水性、抗原指数及表面可及性预测结果分析,推测该蛋白含有14个优势B细胞抗原表位。结论本研究克隆了沙眼衣原体PmpF基因,推测其表达蛋白含B细胞抗原表位。为研究此基因的生物学功能奠定了基础。
【作者单位】： 河北北方学院病原生物学研究所;
【关键词】： 沙眼衣原体 PmpF基因 克隆 序列测定 生物信息学分析
【基金】：河北北方学院创新人才项目(No.CXRC1317) 河北北方学院青年基金项目(No.Q2013030)
【分类号】：R374.1
【正文快照】： ***沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis,Ct)引起性传播疾病最常见的病原体之一,其中性病淋巴肉芽肿生物型(lymphogranuloma venereum,LGV)引起的性病淋巴肉芽肿与梅毒、淋病和软下疳统称为经典性病。LGV包括L1、L2和L3三个血清型,其中血清型L2侵袭力最强,感染者不仅治疗疗程长

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 刘光桥;宋立华;邱少富;端青;;沙眼衣原体多形态膜蛋白D基因序列分析及其B细胞抗原表位预测[J];微生物学免疫学进展;2008年03期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 刘月;张宇飞;张亚坤;孙晓林;刘淑英;;绵羊肺腺瘤病毒NM株囊膜蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位预测[J];动物医学进展;2013年01期

2 鱼轲;魏至栋;蒋琳;;轮状病毒LLR株VP7抗原表位的预测与验证[J];微生物学免疫学进展;2011年01期

3 李士颖;朱玉霞;葛进;姚卫锋;;衣原体噬菌体Chp4衣壳蛋白Vp1二级结构及B细胞抗原表位预测[J];武警后勤学院学报(医学版);2013年11期

中国博士学位论文全文数据库 前1条

1 王则宇;α-甘露糖苷酶活性在沙眼衣原体侵染细胞中的作用及其诊断价值的研究[D];郑州大学;2014年

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 刁庆春,龚小云,郑江,郑红;荧光PCR技术对200例淋球菌、沙眼衣原体、解脲支原体检测结果分析[J];岭南皮肤性病科杂志;2002年03期

2 ;完成沙眼衣原体基因图谱[J];现代临床医学生物工程学杂志;2002年01期

3 延海秀,侯善启,刘颖;感染性病沙眼衣原体情况的调查研究[J];现代中西医结合杂志;2003年05期

4 张雄鹰;查国章;余平;;沙眼衣原体K血清型诱导细胞凋亡[J];中国皮肤性病学杂志;2006年08期

5 曹文苓;梁艳华;叶兴东;李平;黎小东;吴德标;黄雪梅;汤少开;张莉;毕超;;2007年广州市沙眼衣原体实验室检测室间质量评价[J];热带医学杂志;2009年07期

6 邵丽丽;江勇;杨丽娜;杨晓静;刘原君;王梅;尤聪;刘全忠;;增加传代次数对沙眼衣原体细胞培养阳性率的影响[J];中国皮肤性病学杂志;2013年06期

7 霍治;余平;程文;;沙眼衣原体初次和再次感染小鼠生殖道的初步研究(英文)[J];中国人兽共患病学报;2013年10期

8 表钟九;婴儿衣原体感染时母亲的感染状况[J];国外医学(儿科学分册);1987年01期

9 戚娅萍;;从有和没有症状的妇女子宫内膜分离沙眼衣原体[J];地方病译丛;1989年06期

10 陶沙;范明远;;沙眼衣原体质粒DNA研究新进展[J];国外医学(微生物学分册);1990年05期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 江勇;杨丽娜;刘原君;刘全忠;;沙眼衣原体培养过程中耐甲氧西林表皮葡萄球菌污染的防控[A];中华医学会第16次全国皮肤性病学术年会摘要集[C];2010年

2 朱慧玲;李红梅;张勤奋;陈木开;韩建德;;沙眼衣原体持续感染模型及快速鉴定方法的研究[A];中华医学会第十八次全国皮肤性病学术年会论文汇编[C];2012年

3 刘全忠;;沙眼衣原体治疗现况和噬菌体的研究进展[A];中华医学会第16次全国皮肤性病学术年会摘要集[C];2010年

4 肖萌;刘全忠;;沙眼衣原体免疫优势蛋白的研究进展[A];中华医学会第十八次全国皮肤性病学术年会论文汇编[C];2012年

5 刘原君;齐蔓莉;绍丽丽;盛彩虹;姚卫锋;侯淑萍;刘全忠;;沙眼衣原体标准株不同型之间的差异性探讨[A];中华医学会第十五次全国皮肤性病学术会议论文集[C];2009年

6 刘全忠;江勇;侯淑萍;邵丽丽;杨晓静;杨丽娜;;迁延难愈沙眼衣原体泌尿生殖系感染的临床与实验研究[A];中华医学会第十五次全国皮肤性病学术会议论文集[C];2009年

7 杨斌;郑和平;薛耀华;吴兴中;江汉宁;黄进梅;;广州地区泌尿生殖道沙眼衣原体基因分型研究[A];2010全国中西医结合皮肤性病学术会议论文汇编[C];2010年

8 邵丽丽;江勇;杨丽娜;杨晓静;刘原君;刘全忠;;299例泌尿生殖道沙眼衣原体的检测及药物敏感性分析[A];中华医学会第十五次全国皮肤性病学术会议论文集[C];2009年

9 吴伊旋;陆平;沈志鸿;刘怡文;;272例泌尿生殖道感染沙眼衣原体或解脲支原体患者临床分析[A];2001年中国中西医结合皮肤性病学术会议论文汇编[C];2001年

10 刘全中;杨士强;傅志宜;王树椿;缴稳玲;田静群;;迁延难愈沙眼衣原体泌尿生殖道感染——几种抗生素的疗效评定和随访[A];2002中国中西医结合皮肤性病学术会议论文汇编[C];2002年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 韩莉;“沙眼衣原体”也会入侵生殖系统[N];中国人口报;2006年

2 汪涛;孕妇感染沙眼衣原体危害大[N];大众卫生报;2007年

3 柯春荣;沙眼衣原体可导致不孕[N];大众卫生报;2003年

4 邓启泰;“沙眼衣原体”个头小危害大[N];医药养生保健报;2006年

5 韩丽;衣原体还能引起泌尿系感染[N];医药养生保健报;2007年

6 季建业;沙眼也可致性病[N];中国消费者报;2001年

7 凹凸;沙眼衣原体可致不孕[N];大众卫生报;2001年

8 江锦琦;女性感染沙眼衣原体可致不孕[N];中国中医药报;2001年

9 林国瑞;女性滥交易染衣原体[N];医药养生保健报;2007年

10 于泓珍;淋球菌与沙眼衣原体引起的感染[N];农村医药报（汉）;2007年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 王千秋;泌尿生殖道沙眼衣原体感染的某些血清学和分子生物学研究[D];中国协和医科大学;1997年

2 李建红;沙眼衣原体高分辨率溶解曲线基因分型方法的建立及其在男男性行为者流行病学调查中的应用[D];北京协和医学院;2010年

3 江勇;沙眼衣原体临床株体外药物敏感性与耐药机制的研究[D];天津医科大学;2008年

4 粟玉珍;沙眼衣原体热休克蛋白60与免疫致病[D];中国医科大学;2002年

5 高省;女性高危人群生殖道沙眼衣原体感染的分子流行病学研究[D];中国协和医科大学;2007年

6 王蕊;HaCaT细胞培养沙眼衣原体及体外药敏试验的探索[D];天津医科大学;2012年

7 白光春;沙眼衣原体重组口服活疫苗的构建及其免疫学特性的初步研究[D];第四军医大学;1999年

8 李元;沙眼衣原体18KDa粘连蛋白的初步研究[D];第四军医大学;1995年

9 杜昆;沙眼衣原体CT703蛋白在感染细胞中的表达及功能初探[D];中南大学;2011年

10 尚淑贤;沙眼衣原体药物敏感性试验方法的建立及其临床意义的初步探讨[D];中国协和医科大学;2005年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 尤聪;沙眼衣原体培养阳性率提高及临床株热休克蛋白60的转录随传代的变化[D];天津医科大学;2012年

2 邵丽丽;沙眼衣原体抗菌素耐药及治疗失败的评估[D];天津医科大学;2010年

3 朱辉;大环内酯类药物次抑菌浓度诱导沙眼衣原体耐药的实验研究[D];天津医科大学;2010年

4 侯淑萍;天津市耐药沙眼衣原体野生株的细胞学及基因学研究[D];天津医科大学;2004年

5 姜慧芬;沙眼衣原体主要外膜蛋白重组质粒的构建、表达和活性鉴定[D];浙江大学;2010年

6 陈伟;沙眼衣原体泌尿生殖道感染迁移性临床研究[D];天津医科大学;2007年

7 展小飞;泌尿生殖道沙眼衣原体的随访和治疗方法的评估及病程与维生素D3水平的联系[D];天津医科大学;2012年

8 布晓坤;中性粒细胞在沙眼衣原体小鼠肺炎易感性差异免疫学机制的研究[D];天津医科大学;2008年

9 周隽;电穿孔转化沙眼衣原体建立衣原体载体实验研究[D];华中科技大学;2006年

10 王梅;泌尿生殖道沙眼衣原体体外单独和联合药物敏感性检测[D];天津医科大学;2011年

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本文编号：902054