用于单核苷酸多态性数据聚类分析的方法比较

发布时间：2017-09-23 08:15

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【摘要】：对于目前用于单核苷酸多态性(SNPs)数据进行聚类分析的统计方法进行了比较说明,并在其中遴选出了5种具有代表性的统计方法 ,分别对每种方法具体进行分析。在每种聚类方法的论述过程中,均分为该方法的原理、计算方法和公式、优点与缺陷几个部分。并且在讨论部分对各种方法进行了总结归纳,提出了今后针对SNPs数据聚类计算方法的发展方向预测。
【作者单位】： 首都医科大学公共卫生学院;北京市丰台区南苑社区卫生服务中心;
【关键词】： 单核苷酸多态性 聚类分析 基因 数据挖掘
【分类号】：R394
【正文快照】： 在人类的基因组中存在各种形式的变异,其中,单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphisms,SNPs),即单个的核苷酸变异所引发的DNA链序列的多态性,是这些变异中最普遍的形式。根据数据统计,在人类含有不低于30亿个含氮碱基对数量的基因组中,SNP出现的概率在1/1000左右[1]。

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本文编号：904162