柯萨奇病毒A16型VP1基因和病毒生物物理学分析
本文关键词:柯萨奇病毒A16型VP1基因和病毒生物物理学分析
【摘要】:目的分析柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)西安分离株VP1基因序列,探讨西安分离株基因亚型以及病毒颗粒的生物学特性。方法采集临床诊断为手足口病患儿的粪便标本,RTPCR方法检测粪便标本,CoxA16核酸检测阳性的粪便标本经处理后接种于RD细胞分离病毒。扩增CoxA16分离株VP1基因序列并测序。利用DNA Man、ClustalX 1.83和MEGA 4.0软件分析VP1基因和氨基酸序列。纯化CoxA16病毒颗粒,福尔马林灭活后电镜观察病毒颗粒的形状。结果成功从粪便标本中分离CoxA16病毒株,并获得CoxA16分离株VP1基因序列,该核苷酸编码区序列长度为891 bp,编码297个氨基酸序列;VP1基因比对显示,该分离株与其他不同地区的代表株核苷酸和氨基酸同源性分别为76.76%~97.57%和92.16%~100.0%;种系进化分析显示分离株属于B1a基因亚型的一个分支,与BJ10-03同属一个分支。透射电镜下病毒颗粒为20面体立体对称,病毒颗粒大小均匀,直径为20~30nm。结论西安CoxA16分离株属于B1a基因亚型,分离株在形态上与其他肠道病毒相似。
【作者单位】: 陕西省人民医院中心实验室;陕西省人民医院儿科;
【关键词】: 手足口病 柯萨奇A组型 种系发生树
【基金】:“传染病监测技术平台”项目(No.2013ZX10004202-001-002)
【分类号】:R373
【正文快照】: 手足口病是由肠道病毒引起的感染性疾病,1:1、1%胎牛血清)。接种COXA16病毒阳性分离上1957年首次在新西兰报道,5岁以下儿童普遍易感。清0.5 ml,置于35°C、5%(:02的细胞培养箱中培养,柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)和肠道病毒71 每天用倒置显微镜观察细胞形态,当CPE达到型(EV71)是
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前3条
1 曲梅;李洁;贾蕾;檀晓娟;高志勇;严寒秋;郭婧;李锡太;黎新宇;王全意;许文波;黄芳;;北京市2009年手足口病的病原构成及柯萨奇A组16型病毒基因特征分析[J];病毒学报;2010年06期
2 黄威;周帅锋;张帆;陈雨;刘运芝;檀晓娟;许文波;张红;;2008-2010年湖南省哨点医院手足口病病原学检测结果及基因特征分析[J];实用预防医学;2011年05期
3 杨朝辉;尹少甫;张宗久;许文波;;柯萨奇病毒A组16型[J];中国疫苗和免疫;2009年01期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 夏志才;王辉;;2008年宣城市手足口病流行病学特征分析[J];安徽预防医学杂志;2009年06期
2 王娟;罗珍;范东瀛;高娜;朱俊萍;安静;;2007-2008年北京地区CA16VP1区系统进化分析[J];第三军医大学学报;2009年23期
3 孙良;万俊峰;;手足口病重复感染的系统综述[J];安徽预防医学杂志;2013年06期
4 张盛;张勇;檀晓娟;林艺;王连森;祝双利;李晓嫘;王东艳;徐爱强;裴耀文;王显军;许文波;;2007~2012年山东省临沂市手足口病流行病学和肠道病毒71型基因特征分析[J];病毒学报;2014年03期
5 于德山;张勇;陈建华;段莉平;赵晓虹;李晓嫘;孙强;陈晓;刘建锋;郑云鹤;孟蕾;;甘肃省2008~2012年手足口病流行特征及病原学研究[J];病毒学报;2014年01期
6 陈祥鹏;檀晓娟;许文波;;柯萨奇病毒A组16型分子流行病学和疫苗研究进展[J];病毒学报;2014年04期
7 李艳芬;杨华可;袁达康;黄勇;陈永迪;黎景全;周建孟;;2010—2012年东莞市手足口病病原学监测结果分析[J];华南预防医学;2014年03期
8 王树海;王晓宁;刘京;;利巴韦林气雾剂治疗儿童手足口病的随机双盲多中心临床研究[J];世界临床药物;2014年10期
9 武恕星;武景福;杨洁;卫海燕;许玉玲;黄学勇;;三门峡市手足口病病原分离检测及肠道病毒71型VP1基因分析[J];病毒学报;2014年06期
10 黎祖秋;;手足口病流行及防治研究进展[J];应用预防医学;2015年01期
中国重要会议论文全文数据库 前4条
1 H.Yaqing;Z.Wenping;Y.Zhiyi;W.Xionghu;Y.Shouyi;Y.Hong;D.Yingchun;H.Guifang;;Detection of human Enterovirus 71 reverse transcription loop-mediated isothermal amplification(RT-LAMP)[A];2012深圳市预防医学会学术研讨会论文汇编[C];2012年
2 H.Yaqing;Z.Wenping;Y.Zhiyi;W.Xionghu;Y.Shouyi;Y.Hong;D.Yingchun;H.Guifang;;Detection of human Enterovirus 71 reverse transcription loop-mediated isothermal amplification(RT-LAMP)[A];2012广东省预防医学会学术年会资料汇编[C];2013年
3 何雅青;Long Chen;Wen-Bo Xu;Hong Yang;Han-Zhong Wang;Wen-Ping Zong;Hui-Xia Xiana;Hui-Ling Chen;Xiang-Jie Yao;Zhang-Li Hu;Min Luo;Hai-Long Zhang;Han-Wu Ma;Jin-Quan Cheng;Qian-Jin Feng;De-Jian Zhao;;Emergence,Circulation,and Spatiotemporal Phylogenetic Analysis of Coxsackievirus A6-and Coxsackievirus A10-Associated Hand,Foot,and Mouth Disease Infections from 2008 to 2012 in Shenzhen,China[A];广东省预防医学会优秀论文集[C];2014年
4 Huanying Zheng;陆靖;Yong Zhang;Hiromu Yoshida;Xue Guo;Leng Liu;Hui Li;Hanri Zeng;Ling Fang;Yanling Mo;Lina Yi;Toru Chosa;Wenbo Xu;Changwen Ke;;Prevalence of Nonpolio Enteroviruses in the Sewage of Guangzhou City,China,from 2009 to 2012[A];广东省预防医学会优秀论文集[C];2014年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 王骥涛;2009年河南省洛阳市、开封市手足口病病原谱研究[D];山西大学;2013年
2 吴世嘉;基于上转换荧光纳米探针的高灵敏微生物毒素检测方法研究[D];江南大学;2013年
3 邓军霞;靶向5’UTR的化学修饰siRNAs抑制肠道病毒71型感染的研究[D];第四军医大学;2013年
4 王晓雯;高致病小RNA病毒病毒样颗粒的制备及部分颗粒的免疫研究[D];北京工业大学;2013年
5 魏振宏;重大病毒性疾病病原体对细胞凋亡的影响及对宿主限制因子拮抗功能的研究[D];吉林大学;2013年
6 吕铁钢;肠道病毒71型感染致小鼠脑线粒体损伤及可能机制研究[D];青岛大学;2013年
7 李继安;肠道病毒71型感染对小鼠CPT2、PSGL-1和SCARB2的表达和作用的影响[D];青岛大学;2014年
8 周晓冰;大鼠与Beagle犬肾毒性生物标志物及肠道病毒71型灭活疫苗临床前安全性的研究[D];北京协和医学院;2014年
9 于品;肠道病毒71型手足口病重症发病机制研究[D];北京协和医学院;2014年
10 赵淼;手足口病预防性基因工程重组疫苗的研究[D];北京工业大学;2014年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 刘尚允;CA16在不同温度与pH条件下的增殖动力学初探[D];北京协和医学院;2011年
2 杨赫;人类肠道病毒A组山东地方株的基因型分布及其所致疾病分子流行病学研究[D];山东大学;2011年
3 李岩;河北省致手足口病病原谱及病原基因特征分析[D];河北医科大学;2010年
4 李静;2010年南京市手足口病流行病学和病原学特征分析[D];兰州大学;2012年
5 刘涛;山东省手足口病患者疾病经济负担及影响因素研究[D];山东大学;2013年
6 郭亚男;重症手足口病患儿血中儿茶酚胺含量测定及相关因素分析[D];大理学院;2013年
7 谢振锋;四株CoxA16病毒免疫原性及毒株间交叉保护的比较分析[D];北京协和医学院;2013年
8 黄泓泰;两种G20株CA16病毒颗粒的生物学特性的分析[D];北京协和医学院;2013年
9 刘正玲;CoxA16抗原检测试剂研究及初步应用[D];北京协和医学院;2013年
10 房华丽;手足口病相关病毒VP1蛋白及其菌蜕嵌合抗原免疫效应研究[D];安徽医科大学;2013年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前9条
1 卫灿东,李琳琳,何雅晴,徐星晔,薛颖,金奇;中国柯萨奇病毒A组16型部分VP1区序列测定及系统进化分析[J];病毒学报;2005年03期
2 周帅锋;张帆;黄威;巫森;刘运芝;张红;;2009年湖南省哨点医院手足口病病原学检测与分析[J];南华大学学报(医学版);2010年04期
3 何雅青,丰素娟,刘可,杨洪;2001年深圳地区肠道病毒71型的监测[J];疾病监测;2003年08期
4 许文波;檀晓娟;;手足口病:中国儿童传染病防控面临的新挑战[J];疾病监测;2009年09期
5 王琦;王子军;;2008年中国手足口病流行特征分析[J];疾病监测;2010年03期
6 张红;黄一伟;刘运芝;张帆;黄威;蔡亮;李俊华;;湖南省197例手足口病临床诊断病例的病原学检测结果[J];实用预防医学;2008年06期
7 颜瑾;柯昌文;郑焕英;郭雪;刘冷;;基于VP_4基因扩增和序列测定快速检测鉴别人肠道病毒的研究[J];中国计划免疫;2006年06期
8 檀晓娟;许文波;;肠道病毒71型的分子流行病学现况[J];中国疫苗和免疫;2008年04期
9 杨智宏,朱启昒,李秀珠,王晓红,王建设,胡家瑜,唐伟,崔爱利;2002年上海儿童手足口病病例中肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型的调查[J];中华儿科杂志;2005年09期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前5条
1 樊宝良,李宁,吴常信;依据乳蛋白基因序列构建反刍动物种系发生树的研究[J];遗传学报;2000年06期
2 霍艳英,徐德忠,赵小宁,李如琳,杨海,杨国琦;1株中国人HCV-2a型基因组部分cDNA序列的种系发生树分析[J];中国公共卫生;2001年09期
3 王妮莎;马文丽;危敏;张宝;郑文岭;向星宇;;2000-2009年H1N1甲型流感病毒神经氨酸酶的进化分析和序列解析[J];热带医学杂志;2011年02期
4 陈立,张礼璧,朱晖;一起引发脑膜炎流行的ECHO病毒的序列分析[J];中华实验和临床病毒学杂志;2001年04期
5 ;[J];;年期
,本文编号:973467
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