EXT-2的一个新的缺失突变与遗传性多发性骨软骨瘤的相关性研究

发布时间：2020-08-25 23:37

【摘要】：目的:1、完善新发现的EXT-2基因上c.824-826delGCA突变所导致的遗传性多发性骨软骨瘤家系的临床资料;2、验证此位点的缺失突变是导致该家族发病的主要原因,丰富遗传性多发性骨软骨瘤疾病的基因突变谱,为分子学诊断遗传性多发性骨软骨瘤提供更完善的资料;3、进一步研究此基因突变对转录层面的影响,探索相关的致病机制,为后续研究遗传性多发性骨软骨瘤的信号通路及修饰基因提供参考资料。方法:1、分别前往该家族聚居地江苏太仓及安徽蚌埠实地调查家族成员的患病情况,收集并总结临床资料,绘制家系图谱;2、在征得家族成员同意后,收集该家族14名成员的外周血并抽提DNA,设计突变位点的引物,进行测序验证;3、收集该家族2名患病成员手术切除的3份骨软骨瘤组织作为实验组以及另外三名正常人的膝关节软骨组织作为对照组,在经得相关当事人同意后,抽提软骨组织RNA,并进行转录组测序及生物学分析。结果:1、该家族共有24名成员,其中7名为患病成员,家族患者符合遗传性多发性骨软骨瘤的发病特点;2、外周血DNA测序发现7名家族患病成员均存在EXT-2基因c.824-826delGCA杂合性突变,而未患病家族成员未发现此位点突变;3、转录组测序发现实验组与对照组软骨细胞中的EXT-2基因的表达量并无明显差异;4、实验组和对照组差异基因GO和KEGG富集分析发现EXT-2基因c.824-826delGCA杂合性突变影响与遗传性多发性骨软骨瘤发病相关的生物过程及信号通路。结论:1、该家系为遗传性多发性骨软骨瘤疾病家系;2、该家系发生遗传性多发性骨软骨瘤的主要原因是EXT-2基因c.824_826delGCA突变,为新发现的突变位点;3、EXT-2基因c.824_826delGCA的突变不影响EXT-2基因的表达量,但会通过影响相关的生物过程和信号通路导致遗传性多发性骨软骨瘤的发生。
【学位授予单位】：中国人民解放军海军军医大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R738
【图文】：

先证者,软骨瘤,肩胛骨

我们在前期临床工作中发现一例右肩胛骨处巨大的骨软骨瘤患者（先证者）（图1），伴随全身多处外生性骨疣。并于 2012 年给予手术切除右肩胛骨处肿瘤，术后病理诊断为骨软骨肉瘤。之后我们又发现先证者的父亲及二姐也存在多处骨软骨瘤（图2），据此推测该家族可能为 HME 家系。为进一步研究证实，我们对先证者、先证者父亲、先证者母亲（非患病成员）、先证者二姐的外周血 DNA 以及先证者的肩胛骨软骨组织的 DNA 共 5 个 DNA 样本进行了全基因组检测，结果显示三名患病成员的 4个 DNA 样本 EXT 基因上存在特有且唯一的一个具有破坏性的突变，位于染色体第44114241 号位置 EXT-2 基因 c.824-826delGCA。通过查阅莱登突变数据库（LeidenOpen Variation Database,LOVD,https://databases.lovd.nl/shared/genes）发现该位点为新发现的突变位点。为研究该家系 HME 的发病特点，同时进一步验证新发现的 EXT-2 突变位点为该家系的致病基因

家系图,先证者,软骨瘤,父亲

术后病理诊断为骨软骨肉瘤。之后我们又发现先证者的父亲及二姐也存在多处骨软骨瘤（图2），据此推测该家族可能为 HME 家系。为进一步研究证实，我们对先证者、先证者父亲、先证者母亲（非患病成员）、先证者二姐的外周血 DNA 以及先证者的肩胛骨软骨组织的 DNA 共 5 个 DNA 样本进行了全基因组检测，结果显示三名患病成员的 4个 DNA 样本 EXT 基因上存在特有且唯一的一个具有破坏性的突变，位于染色体第44114241 号位置 EXT-2 基因 c.824-826delGCA。通过查阅莱登突变数据库（LeidenOpen Variation Database,LOVD,https://databases.lovd.nl/shared/genes）发现该位点为新发现的突变位点。为研究该家系 HME 的发病特点，同时进一步验证新发现的 EXT-2 突变位点为该家系的致病基因，并探讨其中的致病机制，我们进行了如下工作：1、收集完善该家系其他成员的临床资料，制定相应的家系图谱，并对其临床特点进行进一步的分析归纳；2、抽取了该家系其他成员的外周血样本

琼脂糖凝胶,检测结果,第一,硕士学位论文

第一组琼脂糖凝胶检测结果

【参考文献】