基于含脑胶质瘢痕临床患者的全外显子测序探究外伤性癫痫发病的遗传学机制

发布时间：2021-02-03 10:24

　　目的:1、通过结合临床上医学影像学和脑电图等表征手段,分析外伤性癫痫的主要病症表现,并探讨脑胶质瘢痕与外伤性癫痫的关系,为进一步深入系统地研究外伤性癫痫的发病机制寻找切入点。2、通过抽取外伤性癫痫患者的外周血,提取其中的DNA进行全外显子测序,筛选与脑胶质瘢痕和外伤性癫痫相关的变异基因,探讨脑外伤胶质瘢痕形成的遗传学基础。方法:1、收集临床上有明确外伤史,无癫痫病史的外伤性癫痫患者9名作为实验组,非外伤性癫痫患者3名作为对照组,分别利用磁共振成像仪、脑电图等医学设备对患者的脑部进行成像定位,观察分析手术前的脑胶质瘢痕的形态及分布情况及手术切除的癫痫灶的病理染色特征。2、抽取外伤性癫痫患者的外周血,提取其中的DNA进行全外显子测序,筛选出与外伤性癫痫和脑胶质瘢痕相关的基因,并对筛选出的结果进行功能性富集和蛋白质相互作用关系的分析。结论:1、通过利用临床医学影像学的表征手段对患者脑部病灶部位的成像,我们观察到了患者病灶部位的脑胶质瘢痕的形态和分布情况,并对手术后癫痫灶切片的尺寸进行了测定,证实了脑胶质瘢痕可以作为确诊外伤性癫痫的切入点。2、通过对外伤性癫痫患者体内的DNA进行全外显子测序,... 

【文章来源】：福建医科大学福建省

【文章页数】：90 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

全基因组外显子区域DNA捕捉技术原理示意图

17图2.2全基因组外显子区域DNA富集与测序分析技术原理示意图本研究采用AgilentV660M外显子靶向序列富集系统对人的外显子序列进行捕获。首先，对DNA进行纯度、浓度和体积等方面的检测；对符合质量要求的DNA建立基因组测序文库，形成片段化的基因组序列，该序列两端包含测序接头；基因组DNA文库与探针进行杂交，通过互补配对原则，目标基因组DNA片段与被生物素标记的寡核苷酸探针结合形成杂交复合物；未与探针结合的基因组片段被洗脱纯化，利用PCR扩增捕获片段；对捕获杂交后的文库进行纯度、浓度检测。最后对检测合格的测序文库进行IlluminaHiSeq高通量测序。实验流程如下图2.3所示图2.3全基因组外显子高通量测序实验流程

17图2.2全基因组外显子区域DNA富集与测序分析技术原理示意图本研究采用AgilentV660M外显子靶向序列富集系统对人的外显子序列进行捕获。首先，对DNA进行纯度、浓度和体积等方面的检测；对符合质量要求的DNA建立基因组测序文库，形成片段化的基因组序列，该序列两端包含测序接头；基因组DNA文库与探针进行杂交，通过互补配对原则，目标基因组DNA片段与被生物素标记的寡核苷酸探针结合形成杂交复合物；未与探针结合的基因组片段被洗脱纯化，利用PCR扩增捕获片段；对捕获杂交后的文库进行纯度、浓度检测。最后对检测合格的测序文库进行IlluminaHiSeq高通量测序。实验流程如下图2.3所示图2.3全基因组外显子高通量测序实验流程

【参考文献】：
期刊论文
[1]mTOR/4EBP1/HIF-1α/VEGF信号通路在哮喘小鼠肺组织中的表达及意义[J]. 王莉,张艳丽,王秀芳,宋哲,王伟.  中国当代儿科杂志. 2017(01)
[2]哺乳动物雷帕霉素靶蛋白异常激活区别Ⅱ型和Ⅰ型难治性癫痫相关性局灶性皮质发育不良[J]. 林元相,林堃,康德智,叶忠兴,王行富.  中华实验外科杂志. 2012 (12)
[3]中国汉族瘢痕疙瘩家系的遗传学特征研究[J]. 陈阳,高建华,刘晓军.  南方医科大学学报. 2007(07)
[4]皮层注射氯化亚铁建立外伤性癫痫动物模型[J]. 林元相广州,徐如祥,姜晓丹,康德智,柯以铨,周谷兰,杜谋选,蔡颖谦,秦玲莎.  中华神经医学杂志. 2006(04)
[5]肿瘤坏死因子-α及其受体在非特异性慢性脑炎及非脑炎相关难治性癫痫中的表达及其意义[J]. 林元相,叶忠兴,康德智,林堃,王丰.  中华医学杂志. 2013 (39)

硕士论文
[1]mTOR通路在氯化亚铁诱导的外伤性癫痫大鼠模型额叶皮质及海马中的表达研究[D]. 王艮波.福建医科大学 2015



本文编号：3016350