骨关节炎的lncRNA和circRNA表达谱研究以及氨基葡萄糖联合阿托伐他汀治疗骨关节炎的疗效评价

发布时间：2021-11-12 03:34

　　第一部分骨关节炎的lncRNA和circRNA表达谱研究研究背景:近年来的研究显示,非编码RNA对多种疾病起调控作用。在骨关节炎（OA）的非编码RNA相关研究中,长链非编码RNA（long non-coding RNA,简称 lncRNA）和环状 RNA（Circular RNA,简称circRNA）的表达和调控可能与发病机制相关,但目前它们在OA中的生物学功能和相关信号通路研究较少。目的:初步探明OA软骨组织中lncRNA和circRNA的差异表达情况,预测和分析与OA相关的非编码RNA及其相互作用。方法:收集38例OA患者软骨组织标本,进行适当处理和保存。利用RNA-seq技术（illumina高通量测序平台）进行样本检测和数据收集。对数据进行生物信息学分析,鉴别出差异表达的未确定编码能力的转录物（transcripts of uncertain coding potential,简称 TUCP）和信使RNA（messenger RNA,简称mRNA）,预测靶基因以及竞争内源性 RNA（competing endogenous RNA,简称 ceRNA）。进行蛋白相互作用分析和ce... 

【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章页数】：102 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图１收集到的０Ａ患者的股骨髁截骨块

个丨ｎｃＲＮＡ。共有５８０个ＩｎｃＲＮＡ被鉴定为在轻度和重度组之间差异??表达，其中５２个显著上调，２８２个显著下调（倍数变化＞２．０，?Ｐ值??＜０．〇５）（图３，表２）。在５２个上调的ＩｎｃＲＮＡ中，２７个已被注释，??２５个是新发现的。在２８２个下调的ＩｎｃＲＮＡ中，２１１个被注释，７１个??是新发现的。重度组中，２个上调的ＩｎｃＲＮＡ和１６个下调的ＩｎｃＲＮＡ??与轻度组相比有５．０倍以上的差异。与轻度组相比，ＩｎｃＲＮＡ－ＲＰｌｌ－??８４８Ｐ１．５和ＲＰ１１－１７７Ｇ２３．１分别上调和下调最多。??２６??

ｃｉｒｃＲＮＡｃＪ８６５个ｃｉｒｃＲＮＡ可以定位到至少一个基因。１３２？个ｃｉｒｃＲＮＡ??是新报道的，并且在我们的研究中进行了预测。这些ｃｉｒｃＲＮＡ的长度??分布和来源序列统计显示在图４中。其中，１２７个ｃｉｒｃＲＮＡ在重度组??样本中显著下调，７０个上调（倍数变化＞２．０，?Ｑ值＜０．０１）（表３，图??５）。Ｈｇ３８＿ｃｉｒｃ＿０００７４７４?和?ｈｇ３８＿ｃｉｒｃ＿００００１１８?是最显著上调和下调??的?ｃｉｒｃＲＮＡｓ。??Ａ?Ｂ??－?ｌ￣?Ｉ?１＝．??ｉｋｍ??Ｗ?…＇?ｉ＿ｌｌ＿迦??Ｓｅｖｅｔｅ?Ｓａｍｐｌｅ?Ｍｉｌｄ?Ｓａｍｐｌｅ??图４鉴定的ｃｉｒｃＲＮＡ的特征。Ａ：?ｃｉｒｃＲＮＡ的源序列分类。Ｂ：?ｃｉｒｃＲＮＡ的长度分布。??２８??


本文编号：3490083