丝氨酸羟甲基转移酶2调控肝脏再生肝细胞增殖的机制研究
发布时间：2022-02-25 06:07
目的:死亡供体肝移植（deceased donor liver transplantation,DDLT）过程中缺血再灌注损伤（ischemia reperfusion injury,IRI）及免疫排斥反应会导致大量肝细胞损伤坏死,术后需要通过肝脏再生（liver regeneration,LR）来恢复正常生理功能。活体肝移植（living donor liver transplantation,LDLT）虽然最大程度减轻了IRI,但由于移植物体积过小,因此肝细胞必须快速增殖来达到合适的肝体重比从而满足受体需求。对供体而言,术后其肝脏功能由维持代谢稳态向再生的转化是恢复正常生理功能的基础条件及唯一途径。因此,有效促进LR对LDLT术后供受体肝功能恢复有重要意义。丝氨酸羟甲基转移酶2（Serine hydroxymethyl-transferase 2,SHMT2）是甘氨酸代谢过程的关键酶,近期有研究表明甘氨酸可经Akt-m TOR通路来调控细胞增殖与生存。本研究将利用小鼠原代肝细胞及经典LR模型,从体内外角度探讨通过SHMT2促进LR的可行性并明确相关分子机制。方法:1.利用C57小鼠...
【文章来源】：重庆医科大学重庆市
【文章页数】：98 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
基因芯片质量控制Figure2-1Qualitycontrolofthemicroarray.Relativelogexpression,normalizedunscaled
图 2-2 主成分分析及差异基因聚类分析Figure 2-1 Principal component analysis and cluster analysis of the DEGs. Principalcomponent and cluster analysis suggested that the experiment was reproducible and therewere significant characteristics between SHAM and PH group.2.3 GO 富集分析GO 富集分析有以下三部分组成：生物学过程（Biological process, BP）、细胞组分（Cellular component, CC）、分子功能（Molecular function, MF）。对筛选的DEGs 进行 GO 富集分析并取前 15 位分析结果使用 R 语言进行可视化，结果表明：在 BP 中，DEGs 主要富集于细胞周期、细胞有丝分裂相关；在 CC 中，DEGs 主要富集于染色体、细胞骨架、纺锤体、细胞核等组分；在MF中，DEGs主要富集于ATP结合、核苷酸结合、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性等重要分子功能中。以上结果提示：PH 后 48 h 肝组织内由于大量细胞复制导致 DNA 合成旺盛，该时期对
图 2-3 GO 富集分析Figure 2-3 Gene ontology enrichment analysis. Identified EDGs were applied to gene ontologyanalysis including biological process, cellular component, molecular function analysis and top15 statistically significant results were visualized by R.2.4 KEGG 通路富集分析利用 2.2 步骤中筛选出的 DEGs，通过超几何分布等统计算法根据通路的差异基因数目计算该通路是否具有显著 P 值，随后将前 15 位结果根据 P 值由小到大进行排序。分析结果表明：PH后48 h大量DEGs富集于各类代谢通路，同时富集于细胞周期、甘氨酸/丝氨酸/苏氨酸代谢、p53 信号通路、胆汁酸分泌等 DEGs 具有显著统计学差异，提示：在肝脏再生增殖期大量基因参与包括甘氨酸/丝氨酸/苏氨酸代谢在内的多条代谢通路调节，同时 FoxO、p53、PPAR 等信号通路在该过程中发挥重要作用。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Bioengineered functional humanized livers: An emerging supportive modality to bridge the gap of organ transplantation for management of end-stage liver diseases[J]. Sand Deep Kumar Vishwakarma,Chand rakala Lakkireddy,Avinash Bardia,Syed Ameer Basha Paspala,Chaturvedula Tripura,Md Aejaz Habeeb,Aleem Ahmed Khan. World Journal of Hepatology. 2018(11)
[2]Human hepatocytes loaded in 3D bioprinting generate mini-liver[J]. Cheng Zhong,Hai-Yang Xie,Lin Zhou,Xiao Xu,Shu-Sen Zheng. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2016(05)
[3]Liver cell transplantation for Crigler-Najjar syndrome type Ⅰ: Update and perspectives[J]. Philippe A Lysy,Mustapha Najimi,Xavier Stéphenne,Annick Bourgois,Franoise Smets,Etienne M Sokal. World Journal of Gastroenterology. 2008(22)
本文编号：3643843
【文章来源】：重庆医科大学重庆市
【文章页数】：98 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
基因芯片质量控制Figure2-1Qualitycontrolofthemicroarray.Relativelogexpression,normalizedunscaled
图 2-2 主成分分析及差异基因聚类分析Figure 2-1 Principal component analysis and cluster analysis of the DEGs. Principalcomponent and cluster analysis suggested that the experiment was reproducible and therewere significant characteristics between SHAM and PH group.2.3 GO 富集分析GO 富集分析有以下三部分组成：生物学过程（Biological process, BP）、细胞组分（Cellular component, CC）、分子功能（Molecular function, MF）。对筛选的DEGs 进行 GO 富集分析并取前 15 位分析结果使用 R 语言进行可视化，结果表明：在 BP 中，DEGs 主要富集于细胞周期、细胞有丝分裂相关；在 CC 中，DEGs 主要富集于染色体、细胞骨架、纺锤体、细胞核等组分；在MF中，DEGs主要富集于ATP结合、核苷酸结合、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性等重要分子功能中。以上结果提示：PH 后 48 h 肝组织内由于大量细胞复制导致 DNA 合成旺盛，该时期对
图 2-3 GO 富集分析Figure 2-3 Gene ontology enrichment analysis. Identified EDGs were applied to gene ontologyanalysis including biological process, cellular component, molecular function analysis and top15 statistically significant results were visualized by R.2.4 KEGG 通路富集分析利用 2.2 步骤中筛选出的 DEGs，通过超几何分布等统计算法根据通路的差异基因数目计算该通路是否具有显著 P 值，随后将前 15 位结果根据 P 值由小到大进行排序。分析结果表明：PH后48 h大量DEGs富集于各类代谢通路，同时富集于细胞周期、甘氨酸/丝氨酸/苏氨酸代谢、p53 信号通路、胆汁酸分泌等 DEGs 具有显著统计学差异，提示：在肝脏再生增殖期大量基因参与包括甘氨酸/丝氨酸/苏氨酸代谢在内的多条代谢通路调节，同时 FoxO、p53、PPAR 等信号通路在该过程中发挥重要作用。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Bioengineered functional humanized livers: An emerging supportive modality to bridge the gap of organ transplantation for management of end-stage liver diseases[J]. Sand Deep Kumar Vishwakarma,Chand rakala Lakkireddy,Avinash Bardia,Syed Ameer Basha Paspala,Chaturvedula Tripura,Md Aejaz Habeeb,Aleem Ahmed Khan. World Journal of Hepatology. 2018(11)
[2]Human hepatocytes loaded in 3D bioprinting generate mini-liver[J]. Cheng Zhong,Hai-Yang Xie,Lin Zhou,Xiao Xu,Shu-Sen Zheng. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2016(05)
[3]Liver cell transplantation for Crigler-Najjar syndrome type Ⅰ: Update and perspectives[J]. Philippe A Lysy,Mustapha Najimi,Xavier Stéphenne,Annick Bourgois,Franoise Smets,Etienne M Sokal. World Journal of Gastroenterology. 2008(22)
本文编号：3643843
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