三阴性与三阳性乳腺癌定量蛋白质组学和生物信息学比较研究

发布时间：2017-06-26 00:13

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【摘要】：目的雌/孕激素受体(estrogen receptor/progesterone receptor,ER/PR)和癌基因人表皮生长因子受体2(human epidermal growth factorreceptor2,HER2)与乳腺癌的发生和发展密切相关,其表达状态是乳腺癌分子分型、治疗方案选择和预后预测的重要依据。为了深入探讨ER/PR/HER2在乳腺癌发生和恶性演进中的意义及相关机制,拟建立ER/PR/HER-2阴性和阳性乳腺癌的蛋白质表达谱,寻找ER/PR/HER-2阴性和阳性乳腺癌中差异表达蛋白,为乳腺癌患者提供新的预后预测指标和治疗新靶点。方法应用蛋白质组学同位素相对标记与绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技术建立ER/PR/HER-2阳性和阴性乳腺癌的蛋白质差异表达谱,鉴定2组乳腺癌的差异表达蛋白,对部分差异表达蛋白进行生物信息学分析,包括蛋白功能注释、基因本体论分类分析(gene ontology classification analysis,GO分析)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of gene and genome,KEGG)通路分析。结果应用iTRAQ蛋白质组学技术对乳腺癌组织进行了蛋白组学分析,鉴定出ER/PR/HER-2阳性和阴性组间有差异表达的蛋白4 999种,以ER/PR/HER-2阳性∶ER/PR/HER-2阴性≥3为上调标准,确定ER/PR阳性组上调蛋白73种。以ER/PR/HER-2阳性∶ER/PR/HER-2阴性≤0.5为下调标准,ER/PR/HER-2阳性组下调蛋白58种。GO分析结果显示,ER/PR/HER-2阴性和阳性乳腺癌差异表达蛋白的分子功能、生物过程和细胞定位较为复杂,并且在上调蛋白和下调蛋白上存在分布差异。KEGG通路分析发现,部分差异表达蛋白涉及200条信号通路。结论 ER/PR/HER-2阳性和阴性乳腺癌间存在差异表达蛋白,这些蛋白涉及复杂的分子功能、生物过程和信号通路,可能与ER/PR/HER-2的表达状态有关。
【作者单位】： 湖南省肿瘤医院·中南大学湘雅医学院附属肿瘤医院乳腺内科;湖南省肿瘤医院·中南大学湘雅医学院附属肿瘤医院病理科;
【关键词】： 雌激素受体 孕激素受体 人类表皮生长因子受体 HER 定量蛋白质组学 乳腺癌
【基金】：湖南省科学技术厅科技计划专项项目(2014FJ6090)
【分类号】：R737.9
【正文快照】： 中华肿瘤防治杂志,2016,23(16):1053-1059Chin J Cancer Prev Treat,2016,23(16):1053-1059乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,其发病率和死亡率均呈上升及年轻化趋势[1]。雌激素/孕激素/人类表皮生长因子受体2(estrogen receptor/progesteronereceptor/human epidermal growth fa

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本文编号：484079