应用基因芯片技术研究喉鳞状细胞癌中circRNA的表达

发布时间：2020-05-26 21:02

【摘要】：目的:越来越多的证据表明环状RNA(circular RNA,circRNA)在调节基因表达中发挥着重要作用,并且circRNA的异常表达已被证实与多种恶性肿瘤的发病存在相关性。然而circRNA在喉鳞状细胞癌中的作用尚不明确。本研究应用基因芯片技术检测喉鳞状细胞癌中circRNA的表达谱,以探寻在喉鳞状细胞癌发病过程中发挥潜在作用的circRNA。方法:运用芯片技术检测5例喉鳞状细胞癌组织与5例正常喉黏膜组织中circRNA的表达情况。使用标准富集分析方法对产生差异表达circRNA的基因进行信号通路分析,以预测相关circRNA的生物学功能。通过即时定量聚合酶链锁反应(qRT-PCR)检测候选circRNA及其预测miRNA的表达水平。运用生物信息学方法构建circRNA-miRNA交互网络以预测circRNA与miRNA的结合情况。结果:通过芯片技术检测到喉鳞状细胞癌和正常喉黏膜组织中存在506个差异表达的circRNA。qRT-PCR 结果证实 hsa circ 0044520 和 hsa circ 0044529 在喉鳞状细胞癌组织中的表达存在显著上调。hsa-miR-4726-5p和hsa-miR-4640-5p是hsa circ_0044520和hsa_circ_0044529的潜在靶miRNA。代谢/信号通路富集分析显示hsa_circ_0044520和hsa_circ_0044529可能参与了胶原蛋白的合成过程。结论:竞争性内源RNA调控网络和生物信息学分析显示:hsa circ_0044520和hsa_circ_0044529可能是通过 hsa-miR-4726-5p 和 hsa-miR-4640-5p 的“海绵作用”,在喉鳞状细胞癌的发病过程中发挥重要的调节作用。
【图文】：

向剪接而形成的内源性非编码ＲＮＡ邋（ｎｏｎｃｏｄｉｎｇＲＮＡ，ｎｃＲＮＡ），，在人类细胞中广泛逡逑存在，在编码基因的表达调控中发挥着重要作用［９，邋１０］。目前的研究发现，生物体逡逑中的ｃｉｒｃＲＮＡ主要通过三种方式发挥作用（图１）逦［１１］：邋（１）顺式调控宿主基因的逡逑表达：通过ＲＮＡ－ＲＮＡ相互作用，影响转录机结构和组成，特异性调控其宿主基因逡逑的表达［１２］；（２）作为内源性１＾

本文编号：2682405