慢性乙型肝炎患者IFN-α治疗无应答与肝组织基因表达差异关系的初步研究
发布时间：2020-12-03 00:44
目的:利用基因芯片技术检测慢性乙型肝炎患者α干扰素（IFN-α）治疗应答者（Rs）和无应答者（NRs）之间肝组织的表达基因差异,探讨IFN-α治疗慢乙肝无应答的分子机制。方法:采用表达谱基因芯片检测IFN-α治疗前患者肝组织的全基因表达情况,筛选出在7例治疗无应答者和6例治疗应答者之间差异表达的基因,对这些差异基因进行Gene Ontology分析和KEGG通路分析,并对部分明显差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证。结果:在NRs和Rs组共筛选出3592个差异表达基因（P <0 .05）,而这些差异基因主要集中在干扰素诱导基因（ISGs）和免疫调节相关基因,且ISGs在治疗前的NRs高表达而免疫调节相关基因低表达。其中,处于一条抑制干扰素信号通路的两个ISGs（USP18和CEB1）在NRs高表达,而具有潜在抗病毒活性的ISG20基因在NRs低表达,这可能和IFN-α治疗无应答密切相关。结论:NRs和Rs在IFN-α治疗前即具有不同的肝脏基因表达谱,在治疗前高表达具有抑制IFN通路的ISGs并抑制免疫反应将预示着治疗无应答,并可望在治疗前成功预测IFN-α治疗效果。
【文章来源】：重庆医科大学重庆市
【文章页数】：49 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
荧光标记反应示意图
图 2 总 RNA 电泳图Figure 2 Electrophoresis Image异表达基因筛选结果 Rs 组和 NRs 组共筛选出 3592 个差异表达基因(P 值和 FDR 均<0.05，数>1.3)，其中 1556 个基因在 IFN-α 治疗前的 NRs 组高表达，而 2036达。利用 Cluster3.0 软件进行无监督遗传聚类分析，发现这 3592 个差分为两个聚类，在无应答组是一个聚类而在应答组是另一个聚类（见图可以说明这 3592 个基因在 NRs 和 Rs 是有显著差异的。
图 2 总 RNA 电泳图Figure 2 Electrophoresis Ima2.3 差异表达基因筛选结果在 Rs 组和 NRs 组共筛选出 3592 个差异表达基因(P差异倍数>1.3)，其中 1556 个基因在 IFN-α 治疗前的 NRs因低表达。利用 Cluster3.0 软件进行无监督遗传聚类分析因可以分为两个聚类，在无应答组是一个聚类而在应答组因此，可以说明这 3592 个基因在 NRs 和 Rs 是有显著差异
【参考文献】：
期刊论文
[1]Cloning,Eukaryotic Expression of Human ISG20 and Preliminary Study on the Effect of Its Anti-HBV[J]. 郝友华,杨东亮. Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences). 2008(01)
[2]Relationship of human leukocyte antigen class II genes with the susceptibility to hepatitis B virus infection and the response to interferon in HBV-infected patients[J]. Yong-Nian Han, Jin-Long Yang, Shui-Gen Zheng, Qun Tang, Wei Zhu, Research Unit of Liver Diseases, Shanghai 8~(th) People’s Hospital, Shanghai 200235, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(36)
[3]In vitro resistance to interferon of hepatitis B virus with precore mutation[J]. Yan Wang, Lai Wei, Dong Jiang, Xu Cong, Ran Fei, Jiang Xiao, Yu Wang, Hepatology Institute, Peking University People’s Hospital, Beijing 100044, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(05)
[4]慢性乙型肝炎干扰素疗效与人类白细胞抗原-等位基因的关系[J]. 奚敏,臧国庆,冯明亮,季芸. 中华传染病杂志. 2004(04)
[5]Gene expression profiles in an hepatitis B virus transfected hepatoblastoma cell line and differentially regulated gene expression by interferon-α[J]. Xun Wang Zheng-Hong Yuan Ling-Jie Zheng Wei Xiong JiangXia Liu,Department of Molecular Virology,Shanghai Medical College,Fudan University,Shanghai 200032,ChinaFeng Yu Gen-Xi Hu,Institute of Biochemistry and Cell Biology,CAS,Shanghai 20003 I,ChinaYao Li,State Key Laboratory of Genetics,Fudan University School of Life Science,Shanghai 200433,China. World Journal of Gastroenterology. 2004(12)
[6]基因芯片分析干扰素对乙型肝炎病毒转染细胞基因表达的影响(英文)[J]. 熊炜,王迅,刘晓颖,项黎,郑玲洁,刘江霞,袁正宏. 生物化学与生物物理学报. 2003(12)
[7]丙型肝炎病毒基因型及患者人类白细胞抗原对其抗病毒疗效的影响[J]. 焦健,王江滨. 中华肝脏病杂志. 2003(10)
[8]粘病毒抵抗蛋白A和真核细胞起始因子2α调节区2基因多态性与慢性乙型肝炎干扰素治疗效果的相关性[J]. 黄雁翔,马丽娜,陈新月,李卓,黄云丽,沈成利,马冰. 中华肝脏病杂志. 2007 (03)
本文编号：2895713
【文章来源】：重庆医科大学重庆市
【文章页数】：49 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
荧光标记反应示意图
图 2 总 RNA 电泳图Figure 2 Electrophoresis Image异表达基因筛选结果 Rs 组和 NRs 组共筛选出 3592 个差异表达基因(P 值和 FDR 均<0.05，数>1.3)，其中 1556 个基因在 IFN-α 治疗前的 NRs 组高表达，而 2036达。利用 Cluster3.0 软件进行无监督遗传聚类分析，发现这 3592 个差分为两个聚类，在无应答组是一个聚类而在应答组是另一个聚类（见图可以说明这 3592 个基因在 NRs 和 Rs 是有显著差异的。
图 2 总 RNA 电泳图Figure 2 Electrophoresis Ima2.3 差异表达基因筛选结果在 Rs 组和 NRs 组共筛选出 3592 个差异表达基因(P差异倍数>1.3)，其中 1556 个基因在 IFN-α 治疗前的 NRs因低表达。利用 Cluster3.0 软件进行无监督遗传聚类分析因可以分为两个聚类，在无应答组是一个聚类而在应答组因此，可以说明这 3592 个基因在 NRs 和 Rs 是有显著差异
【参考文献】：
期刊论文
[1]Cloning,Eukaryotic Expression of Human ISG20 and Preliminary Study on the Effect of Its Anti-HBV[J]. 郝友华,杨东亮. Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences). 2008(01)
[2]Relationship of human leukocyte antigen class II genes with the susceptibility to hepatitis B virus infection and the response to interferon in HBV-infected patients[J]. Yong-Nian Han, Jin-Long Yang, Shui-Gen Zheng, Qun Tang, Wei Zhu, Research Unit of Liver Diseases, Shanghai 8~(th) People’s Hospital, Shanghai 200235, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(36)
[3]In vitro resistance to interferon of hepatitis B virus with precore mutation[J]. Yan Wang, Lai Wei, Dong Jiang, Xu Cong, Ran Fei, Jiang Xiao, Yu Wang, Hepatology Institute, Peking University People’s Hospital, Beijing 100044, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(05)
[4]慢性乙型肝炎干扰素疗效与人类白细胞抗原-等位基因的关系[J]. 奚敏,臧国庆,冯明亮,季芸. 中华传染病杂志. 2004(04)
[5]Gene expression profiles in an hepatitis B virus transfected hepatoblastoma cell line and differentially regulated gene expression by interferon-α[J]. Xun Wang Zheng-Hong Yuan Ling-Jie Zheng Wei Xiong JiangXia Liu,Department of Molecular Virology,Shanghai Medical College,Fudan University,Shanghai 200032,ChinaFeng Yu Gen-Xi Hu,Institute of Biochemistry and Cell Biology,CAS,Shanghai 20003 I,ChinaYao Li,State Key Laboratory of Genetics,Fudan University School of Life Science,Shanghai 200433,China. World Journal of Gastroenterology. 2004(12)
[6]基因芯片分析干扰素对乙型肝炎病毒转染细胞基因表达的影响(英文)[J]. 熊炜,王迅,刘晓颖,项黎,郑玲洁,刘江霞,袁正宏. 生物化学与生物物理学报. 2003(12)
[7]丙型肝炎病毒基因型及患者人类白细胞抗原对其抗病毒疗效的影响[J]. 焦健,王江滨. 中华肝脏病杂志. 2003(10)
[8]粘病毒抵抗蛋白A和真核细胞起始因子2α调节区2基因多态性与慢性乙型肝炎干扰素治疗效果的相关性[J]. 黄雁翔,马丽娜,陈新月,李卓,黄云丽,沈成利,马冰. 中华肝脏病杂志. 2007 (03)
本文编号：2895713
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