中国人群冠状动脉疾病基因遗传多态性研究

发布时间：2017-10-20 16:24

  本文关键词：中国人群冠状动脉疾病基因遗传多态性研究

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【摘要】：冠状动脉疾病是一种复杂性疾病,在全球范围内具有较高的致死率,严重危害人类健康。由于其发病受到多种因素的影响,使其研究和治疗面临巨大困难。粥样动脉硬化是其发病的主要原因,免疫机制和炎症反应参与病变过程,是许多危险因子相互作用的结果。研究发现,遗传因素占冠状动脉疾病总发病率的40-60%。很难确定其遗传因素,主要是由于其存在表型和遗传异质性、基因与基因之间、基因与环境之间的相互作用。目前,对冠状动脉疾病的遗传学研究主要有三种方式,分别是：连锁分析、关联性分析和大规模的相关性分析,尤其是全基因组关联分析。通过各种的途径,已发现了大量与此疾病相关的基因或易感位点。同时,在冠状动脉疾病模式小鼠中验证了候选基因与疾病的相关性,发现三分之一的基因是通过血脂水平来影响疾病的发生,剩余的基因是通过其他途径参与该疾病。随着研究的不断深入,遗传学研究发现的基因会为药物基因组的个性化治疗提供更为充足的理论依据,在冠状动脉疾病研究中提供越来越大的应用价值。通过对冠状动脉疾病发病原因及其遗传学研究的分析,我们筛选了与其发病相关的基因,并结合基因研究现状选择SNPs在中国人群中进行验证,依据条件结合引物设计共筛选了12个在非亚洲人群中多次验证的SNPs,他们分别位于11个基因上。运用SNaPshot技术检测了所筛选的SNPs,并通过GeneMarker软件统计了各位点的基因型,借助SPSS、R等软件分析了所得数据。结果发现有两个突变位点与冠状动脉疾病有显著的相关性,分别位于VEGFA, MAPK1两个基因上,说明这两个位点可能是中国人群的冠状动脉疾病的易感位点。其余位点与疾病没有相关性,可能是由于人群结构差异造成的。
【关键词】：冠状动脉疾病 单核苷酸多态性 SNaPshot 中国人群
【学位授予单位】：昆明理工大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R543.3
【目录】：

• 摘要6-7
• ABSTRACT7-8
• 缩略表8-11
• 第一章 绪论11-29
• 1.1 冠状动脉疾病的出现12
• 1.2 冠状动脉疾病的发病机制12-14
• 1.3 冠状动脉疾病的遗传基础是一个复杂性状14-15
• 1.4 冠状动脉疾病易感性的遗传结构15-16
• 1.5 候选基因的相关性研究16-19
• 1.6 大规模、系统的、基因相关性研究19-23
• 1.7 鼠基因的研究23-29
• 第二章 中国人群冠状动脉疾病遗传多态性的研究29-43
• 2.1 研究背景29-30
• 2.2 研究对象及仪器30-33
• 2.2.1 研究对象30-31
• 2.2.2 主要试剂31-32
• 2.2.3 主要仪器32-33
• 2.3 研究方法33-35
• 2.3.1 易感SNP位点选择33-34
• 2.3.2 准备样本DNA34-35
• 2.3.3 酶标仪检测DNA的浓度和质量35
• 2.4 基因分型35-37
• 2.4.1 引物设计36-37
• 2.4.1.1 12×PLEX引物设计36-37
• 2.4.1.2 引物稀释及合并37
• 2.5 多重PCR反应37-40
• 2.5.1 多重PCR扩增反应38
• 2.5.2 多重PCR扩增产物的纯化反应38-39
• 2.5.3 单碱基延伸(SBE)反应39
• 2.5.4 单碱基延伸产物的纯化反应39-40
• 2.5.5 3730上机分析准备40
• 2.6 数据统计及分析40-43
• 第三章 实验结果及讨论43-53
• 3.1 位点基因型频数统计43-44
• 3.2 位点差异性分析44-45
• 3.3 位点风险值(OR值)评估45-47
• 3.4 位点与血脂水平相关性分析47-49
• 3.5 讨论49-53
• 致谢53-55
• 参考文献55-77
• 附录A77-79
• 附录B79-82

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本文编号：1068175