最大信息系数在瓣膜性心脏病差异表达miRNA识别中的应用

发布时间：2018-03-15 18:38

  本文选题：生物信息学　切入点：瓣膜性心脏病　出处：《中国科技论文》2017年06期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：将1种称为最大信息系数的新型统计工具引入到表达miRNA的识别中,并应用到瓣膜性心脏病(valvular heart disease,VHD)的miRNA表达谱中识别差异表达miRNA。通过对表达谱GSE28954的分析,最大信息系数方法识别了2个具有强烈差异表达的miRNA,其中,hsa-miR-221*是已有研究未发现的新的差异表达miRNA。实验提示,最大信息系数可用于差异表达miRNA的识别,且其最佳阈值为0.5~0.6。
[Abstract]:A new statistical tool called maximum information coefficient was introduced into the recognition of miRNA, and the differential expression of miRNA was recognized in the miRNA expression profile of valvular heart disease (VHD). Two miRNAs with strong differentially expressed miRNAs were identified by the maximum information coefficient method, among which hsa-miR-221* was a new differentially expressed miRNAs which have not been found in previous studies. The experiment showed that the maximum information coefficient could be used to recognize differentially expressed miRNA, and its optimal threshold was 0.50.0..
【作者单位】： 赣南师范大学数学与计算机科学学院;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(31660321)
【分类号】：R542.5

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本文编号：1616470