利用RNA-seq对山羊房颤模型左心耳组织进行GO和KEGG网络分析

发布时间：2021-01-29 06:13

　　背景心房颤动（房颤,AF）是最常见的心律失常,与中风、心力衰竭等患亡率的增加密切相关。房颤病理生理的研究已近一个世纪的历史,目前的观点认为其发生及维持的分子机制包括:心房电重构、结构重构、收缩重构、自主神经重构、氧化应激、炎症等,但尚不完全清楚,仍需进一步的研究。目的本研究通过左心房快速起搏的方式构建山羊房颤模型,利用深度测序技术RNA-seq检测山羊房颤模型左心耳mRNA表达谱的变化,以期从分子水平揭示房颤发生发展机制,为今后房颤的精准化治疗提供靶点。材料与方法1.选取14只健康雄性山羊,月龄相似,重量18-22 Kg,随机分成对照组（n=7）和实验组（快速起搏组,n=7）。所有山羊均行开胸手术,将起搏电极缝至左心房和右心房,实验组以600次/min持续刺激4 w,对照组不予起搏。并于手术前和手术4 w后分别进行心脏电生理检查,包括心房有效不应期（Atrial effective refractory period,AERP）和猝发刺激。实验结束后留取山羊左心耳组织冻存备用。2.转录组测序分析及验证提取对照组和实验组山羊左心耳组织的总RNA,通过RNA-seq检测两组山羊左心耳组织中... 

【文章来源】： 韩柯 新乡医学院

【文章页数】：69 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

窦性心率及房颤心律心电图（左图为窦性心律,右图为房颤心律

实验组和对照组起搏前、起搏终点AERP检验，pre_pacing表示术前，pacing_ending表示

24ABCD图4对照组、实验组左心耳组织HE及Masson染色图片（左边为对照组，右边为实照组。A、B为HE染色，两组间未观察到明显差异。C、D为Masson染色，两组间胶原容积分数，p>0.05，差异无统计学意义）3mRNAs深度测序结果对照组和实验组山羊模型左心耳组织mRNAs表达谱分析显示：差异表达基因共1079个（FoldChange>1.5且p<0.05），其中上调的有757个，下调的有322个。对对照组和实验组山羊模型左心耳组织中mRNA进行主成分分析（principalcomponentanalysis,PCA），发现N2和C6为离群值，予以剔除，见图5。对差异基因绘制聚类热图（见图6）、火山图（见图7）和MA图（见图8）。

【参考文献】：
期刊论文
[1]白介素-18与心房颤动的相关性研究[J]. 郭媛媛,栾颖,李述峰,李少军.  哈尔滨医科大学学报. 2019(01)



本文编号：3006414