血栓闭塞性脉管炎的SNP靶点分析研究

发布时间：2021-03-12 02:07

　　目的研究血栓闭塞性脉管炎患者的SNP靶点。方法以2016年11月-2019年7月在新疆维吾尔自治区人民医院血管外科和新疆医科大学第一附属医院血管外科就诊的血栓闭塞性脉管炎患者177例为研究对象,以同时期在体检中心86例健康成年男性为对照。采用芯片法筛选差异位点,采用Logistic回归分析,通过质量控制分析确定SNP靶点的研究。对易感SNP所在基因及上下游相关基因进行富集分析,通过富集差异基因的Pathway条目,找寻引起疾病发病及进展的细胞通路。结果通过检验计算SNP与疾病关联的显著性筛选出26个血栓闭塞性脉管炎相关SNP靶点,通过GO与Pathway富集分析,最终获得16个靶点。筛选出26个SNP所在的基因及附近所涉及的基因共84个,其主要作用于细胞粘附,生物粘附,细胞与细胞间粘附,细胞真菌起源的分子应答,调节细胞组件大小,细胞内的信号级联,肿瘤坏死因子生成的正向调控,模式识别受体信号通路,激活先天性免疫,先天性免疫激活反应等生物学过程。结论血栓闭塞性脉管炎与SPN靶点具有相关性。 

【文章来源】：新疆医科大学学报. 2020,43(11)

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 资料与方法
    1.1 一般资料
    1.2 纳入及排除标准[10-11]
    1.3 方法
        1.3.1 样品的制备方法
        1.3.2 基因测序方法
        1.3.3 关联性分析
    1.4 质量控制
    1.5 统计学处理
2 结果
    2.1 芯片扫描结果
    2.2 Logistic回归分析筛选差异位点
    2.3富集分析结果
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]血栓闭塞性脉管炎中西医结合专家共识[J]. Expert Committee of Thromboangiitis Obliterans, Professional Committee of Peripheral Blood Vessels of Chinese Association of Integrative Medicine;.  血管与腔内血管外科杂志. 2019(06)
[2]线粒体损伤与动脉粥样硬化的研究进展[J]. 李翼,吴鹏,彭文夕,谭利兰,危当恒,尹卫东.  生命的化学. 2018(05)
[3]转录因子核因子-κB p65通过miR-17调控血管平滑肌细胞增殖的机制研究[J]. 段力仁,杨栋,张晶,林姝,赵琳,王仑,吕俊远,辛世杰.  中国血管外科杂志(电子版). 2017(02)
[4]彩色多普勒超声检查在下肢动脉硬化闭塞症与血栓闭塞性脉管炎鉴别诊断中的应用研究[J]. 鲁靖.  实用医技杂志. 2017(03)
[5]贝前列素钠联合西洛他唑和瑞舒伐他汀治疗老年糖尿病下肢动脉病变的临床研究[J]. 王芬,王彦,孟海艳.  中西医结合心脑血管病杂志. 2016(06)
[6]氧化应激对内皮细胞NF-κB、iNOS和NO信号表达的影响[J]. 何姜,陈闽,刘小莺,王燕萍,刘礼斌.  福建医科大学学报. 2010(03)



本文编号：3077491