主动脉弓缩窄模型所致小鼠主动脉重塑的lncRNA表达谱分析

发布时间：2021-05-20 13:10

　　目的分析主动脉弓缩窄（TAC）模型所致高压负荷诱导的小鼠主动脉重塑的长链非编码RNA（lncRNA）表达谱并探讨其可能的作用机制。方法取60只8周龄C57BL/6J雄性小鼠,分别构建TAC模型及进行假手术处理,术后1周TAC模型小鼠右颈总动脉/左颈总动脉血流速度比值为5～10时纳入实验组,假手术处理小鼠该比值为<1者纳入对照组,各24只。分别采用HE、Weigert及天狼猩红染色观察血管中膜厚度、中膜层弹力纤维及胶原纤维沉积情况。应用高通量测序技术鉴定差异表达转录本,并通过生物信息学分析的方法解析动脉重塑后转录本的表达变化。结果术后1周,实验组的右颈总动脉/左颈总动脉血流速度比值高于对照组,差异有统计学意义（P<0.001）。术后2周,与对照组相比,实验组升主动脉内径增大,且发生明显重塑,包括中膜增厚、中膜弹力纤维变稀疏以及大量胶原纤维沉积。根据建立的标准[差异倍数≥2,P<0.05,错误发现率（FDR值）<0.05],实验组与对照组在转录水平上共有199个lncRNA发生显著变化。任意挑选6个lncRNA进行qRT-PCR验证,与测序结果一致。预测lncRNA... 

【文章来源】：解放军医学杂志. 2020,45(09)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 动物模型的制备
    1.2 超声检测小鼠血流速度
    1.3 取材及石蜡切片制备
    1.4 升主动脉组织切片染色
    1.5 RNA-seq筛选差异lncRNA
    1.6 qRT-PCR验证RNA-seq效力
    1.7 生物信息学分析
    1.8 统计学处理
2 结 果
    2.1　TAC对主动脉压力及形态的影响
    2.2　RNA-seq筛选出差异表达的lncRNA
    2.3　qRT-PCR验证RNA-seq效力
    2.4 反义预测的靶基因的功能富集分析
    2.5 顺式调控预测的靶基因的功能富集分析
3 讨 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于贝叶斯网络的心血管疾病与其他慢性病因果关系分析[J]. 何旭,钱夕元,阮彤.  郑州大学学报(医学版). 2019(04)
[2]不同心血管危险分层高血压患者肠道菌群多样性分析[J]. 陈维玉,陈扬平,冯婷,胡兴卫,周风云,路祥麒,张秋霞,张新禄,陈鹏,修建成.  实用医学杂志. 2019(09)
[3]高血压或糖尿病及二者联合作用对新发慢性肾脏病的影响[J]. 李俊娟,周靖,李慧英,陆春红,王剑利,黄金杰,鲁德江,吴寿岭.  解放军医学杂志. 2018(10)
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本文编号：3197811