稳定型冠心病患者肠道菌群变化特点的研究
发布时间：2021-06-12 05:29
研究背景:心血管疾病（candiovascular disease,CVD）的发病率与死亡率已跃居世界第一,是当今危害人类健康和生命的主要疾病之一,其中很大部分归因于冠状动脉粥样硬化性心脏病。肠道菌群失调（intestinal dysbacteriosis,ID）是指由于某种原因打破了人体肠道正常菌群的种类、数量、定位以及生物学特点的变化,使肠道菌群之间失去平衡从而产生病理性组合,并危害着人体健康。有研究提示肠道菌群失调与冠心病、心力衰竭、肥胖、高血压病及糖尿病等疾病存在相关性。本实验旨在稳定型冠心病与肠道菌群之间的关系,为肠道菌群与稳定型冠心病的研究进一步提供了理论依据。目的:本研究旨在通过16Sr RNA测序技术分析稳定型冠心病患者的肠道菌群变化特点,研究肠道菌群改变与稳定型冠心病之间的关系,以期为冠心病的防治提供新的靶点和理论依据。方法:13例受试者收集于2018年12月至2019年5月陕西省人民医院心血管内一科的住院患者及门诊健康体检者,分为稳定型冠心患者9例和健康对照组4例。采集研究对象的粪便5g用于提取粪便总DNA,利用16S r RNA测序技术获得基因序列,然后在Illu...
【文章来源】：西安医学院陕西省
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
序列样本拆分统计
西安医学院临床医学硕士专业学位论文28cluster的序列及其代表序列（即为OTU）。对每个样本而言，OTU丰度构成该样本的组成结构。使用R软件ggplot2包中的ggplot函数可对示例样本在各分类水平注释的相对程度进行堆叠图绘制，可视化结果如图3，代表所有样本在各分类水平上的序列注释程度柱形图。横坐标(SampleName)是样品名，纵坐标(SequenceNumberPercent)表示注释到该水平的序列数目占总注释数据的比率，柱状图自上而下的颜色顺序对应于右侧的图例颜色顺序。每个分类水平最高值为1，代表100%的序列都得到了至少在这个级别的注释。本研究结果主要针对每个样本肠道微生物的物种分别在门、纲和属3个水平分类级别进行分析。图3所有样本在各分类水平上的序列注释程度柱形图说明：A样本为稳定型冠心病组，C样本为健康对照组3.4物种组成分析一般进行群落结构分析，可以从两个角度来入手。一是群落结构分布柱状图，可以展示不同样本或者分组整体群落的构成，以及构成之间的差异；二是群落结构分布Heatmap图：可直观展示物种在门纲目科水平的丰度高低。首先，根据图4-A在门水平上群落结构分布柱状图，我们在稳定型冠心病组中发现主要以四大门为主（总占比大于99%），按照占比情况从高到低分别是厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）
西安医学院临床医学硕士专业学位论文31GenusLevelBarplot(C)图4在各分类水平上的序列注释程度柱形图（门、纲、属）说明：treatment代表稳定型冠心病组；Control代表健康对照组3.5样本共有物种分析OTU的丰度揭示了样本肠道菌群的丰富程度。根据分组里每个样本的OTU的丰度可计算出每个样本或组间共同拥有和特有的OTU，可用Veen图表示。从图5可看出共有OTU数是780个，稳定型冠心病组特有OTU数是415个，健康对照组特有OTU数是174个，两组共有OTU数是191个。
【参考文献】：
期刊论文
[1]《中国心血管病报告2018》概要[J]. 胡盛寿,高润霖,刘力生,朱曼璐,王文,王拥军,吴兆苏,李惠君,顾东风,杨跃进,郑哲,陈伟伟. 中国循环杂志. 2019(03)
[2]基于高通量测序技术的冠心病患者肠道菌群多样性研究[J]. 胡海兵,崔立,郭靓骅,王春艳,华修国,余强,尹桂芝. 上海交通大学学报(农业科学版). 2016(02)
[3]role of the normal gut microbiota[J]. Sai Manasa Jandhyala,Rupjyoti Talukdar,Chivkula Subramanyam,Harish Vuyyuru,Mitnala Sasikala,D Nageshwar Reddy. World Journal of Gastroenterology. 2015(29)
[4]我国冠心病研究主要成就[J]. 高润霖,吴锡桂,陈纪林,陈保生,冯宗忱. 中华心血管病杂志. 1999(05)
硕士论文
[1]肠道菌群与糖尿病发生关系的研究[D]. 王娜.大连医科大学 2011
本文编号：3226042
【文章来源】：西安医学院陕西省
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
序列样本拆分统计
西安医学院临床医学硕士专业学位论文28cluster的序列及其代表序列（即为OTU）。对每个样本而言，OTU丰度构成该样本的组成结构。使用R软件ggplot2包中的ggplot函数可对示例样本在各分类水平注释的相对程度进行堆叠图绘制，可视化结果如图3，代表所有样本在各分类水平上的序列注释程度柱形图。横坐标(SampleName)是样品名，纵坐标(SequenceNumberPercent)表示注释到该水平的序列数目占总注释数据的比率，柱状图自上而下的颜色顺序对应于右侧的图例颜色顺序。每个分类水平最高值为1，代表100%的序列都得到了至少在这个级别的注释。本研究结果主要针对每个样本肠道微生物的物种分别在门、纲和属3个水平分类级别进行分析。图3所有样本在各分类水平上的序列注释程度柱形图说明：A样本为稳定型冠心病组，C样本为健康对照组3.4物种组成分析一般进行群落结构分析，可以从两个角度来入手。一是群落结构分布柱状图，可以展示不同样本或者分组整体群落的构成，以及构成之间的差异；二是群落结构分布Heatmap图：可直观展示物种在门纲目科水平的丰度高低。首先，根据图4-A在门水平上群落结构分布柱状图，我们在稳定型冠心病组中发现主要以四大门为主（总占比大于99%），按照占比情况从高到低分别是厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）
西安医学院临床医学硕士专业学位论文31GenusLevelBarplot(C)图4在各分类水平上的序列注释程度柱形图（门、纲、属）说明：treatment代表稳定型冠心病组；Control代表健康对照组3.5样本共有物种分析OTU的丰度揭示了样本肠道菌群的丰富程度。根据分组里每个样本的OTU的丰度可计算出每个样本或组间共同拥有和特有的OTU，可用Veen图表示。从图5可看出共有OTU数是780个，稳定型冠心病组特有OTU数是415个，健康对照组特有OTU数是174个，两组共有OTU数是191个。
【参考文献】：
期刊论文
[1]《中国心血管病报告2018》概要[J]. 胡盛寿,高润霖,刘力生,朱曼璐,王文,王拥军,吴兆苏,李惠君,顾东风,杨跃进,郑哲,陈伟伟. 中国循环杂志. 2019(03)
[2]基于高通量测序技术的冠心病患者肠道菌群多样性研究[J]. 胡海兵,崔立,郭靓骅,王春艳,华修国,余强,尹桂芝. 上海交通大学学报(农业科学版). 2016(02)
[3]role of the normal gut microbiota[J]. Sai Manasa Jandhyala,Rupjyoti Talukdar,Chivkula Subramanyam,Harish Vuyyuru,Mitnala Sasikala,D Nageshwar Reddy. World Journal of Gastroenterology. 2015(29)
[4]我国冠心病研究主要成就[J]. 高润霖,吴锡桂,陈纪林,陈保生,冯宗忱. 中华心血管病杂志. 1999(05)
硕士论文
[1]肠道菌群与糖尿病发生关系的研究[D]. 王娜.大连医科大学 2011
本文编号：3226042
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/xxg/3226042.html
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