全基因组甲基化谱和表达谱联合建立骨髓增生异常综合征的CpG岛甲基化表型及其临床价值

发布时间：2021-11-21 20:29

　　背景和目的：CpG岛甲基化表型（CpG island methylator phenotype, CIMP）是存在于多种肿瘤中的一种表观遗传学现象,参与肿瘤的发生发展。异常DNA甲基化的明确可用于肿瘤的早期诊断、治疗以及风险评估。本研究的目的是明确骨髓增生异常综合征（myelodysplastic syndrome, MDS）的CIMP,为MDS的早期诊断和预后预测提供新的生物标记物。方法：我们使用Illumina450k甲基化芯片和Agilent全基因组表达谱芯片进行差异基因筛选,筛选出高甲基化低表达基因初步建立MDS的CIMP。通过甲基化特异性PCR （methylation-specific PCR, MSP）验证基因的甲基化、重硫酸盐测序（bisulfite-sequencing PCR cloning and sequencing, BSP）验证MSP的准确性和实时荧光定量PCR （real-time PCR, qRT-PCR）验证基因表达的方法在样本病例组及对照组中对筛选出的基因进行进一步验证。然后通过诊断试验评价的方法评价高甲基化基因单独或联合诊断MDS的效能。并通过Ka... 

【文章来源】：复旦大学上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：114 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１．表观遗传学机制??除外ＤＮＡ序列的变化外的染色体结构的变异，从而调节基因组的作用，包括ＤＮＡ??

在ＤＮＡ甲基化转移酶的作用下，将Ｓ－腺巧甲硫氨酸提供的甲基基团（－Ｃ拟）??转移到胞喀巧和鸟嘿岭（ＣｐＧ）二核肯酸的胞喀馆５位碳原子上形成５－甲基胞嗦??巧的过程（图２）。ＤＮＡ甲基化在正常细胞中主要表现为肿瘤抑癌基因和组织特??异基因的低甲基化，转录因子、其他细胞类型的组织特异基因１＾＞１及病毒ＤＮＡ的??高甲基化ｐｙ。在肿瘤中主要表现为，启动子区ＣｐＧ岛的异常高甲基化和全基因??组范围的低甲基化Ｐ６—２８１。ＤＮＡ的高甲基化可使肿瘤抑癌基因失活，ＤＮＡ的低甲??基化可使原癌基因激活，这两种情况均可致使肿瘤的发生发展Ｐｓ’２９ｌ?（图３）。研??究表明在血液系统恶性疾病及其他类型的肿瘤中，启动子区ＣｐＧ岛异常高甲基??６??

高甲基化ｐｙ。在肿瘤中主要表现为，启动子区ＣｐＧ岛的异常高甲基化和全基因??组范围的低甲基化Ｐ６—２８１。ＤＮＡ的高甲基化可使肿瘤抑癌基因失活，ＤＮＡ的低甲??基化可使原癌基因激活，这两种情况均可致使肿瘤的发生发展Ｐｓ’２９ｌ?（图３）。研??究表明在血液系统恶性疾病及其他类型的肿瘤中，启动子区ＣｐＧ岛异常高甲基??６??

【参考文献】：
期刊论文
[1]CpG island methylator phenotype in plasma is associated with hepatocellular carcinoma prognosis[J]. Ji-Bin Liu,Yi-Xin Zhang,Ke-Ping Chen,Institute of Life Sciences,Jiangsu University,Zhenjiang 212013,Jiangsu Province,ChinaJi-Bin Liu,Min-Xin Shi,Jin Cai,Yan Liu,Fu-Lin Qiang,Institute of Tumor,Nantong Tumor Hospital,Nantong 226361,Jiangsu Province,China Shu-Hui Zhou,Department of Radiology,School of Radiology and Public Health,Soochow University,Suzhou 215006,Jiangsu Province,China.  World Journal of Gastroenterology. 2011(42)



本文编号：3510186